More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  79.72 
 
 		 217 aa  346  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  76.39 
 
 		 216 aa  339  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  75 
 
 		 216 aa  334  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  57.97 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  54.17 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  55.56 
 
 		 216 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  58.25 
 
 		 216 aa  237  9e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  54.85 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  54.85 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  54.85 
 
 		 236 aa  234  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  54.38 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  54.38 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  54.38 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  54.38 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  54.38 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  50.92 
 
 		 224 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  50.93 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  50.46 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  50.46 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  50.46 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  50.46 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  50.46 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  47.91 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  47.91 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  47.91 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  46.05 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  46.79 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  46.79 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  45.83 
 
 		 216 aa  214  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  45.83 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  45.83 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  45.83 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  45.83 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  45.83 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  45.83 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  48.8 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  49.49 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  46.57 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  43.93 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  45.58 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  45.12 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  45.58 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  45.58 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  48.06 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  47.09 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  45.71 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  44.22 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  43.54 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  40.83 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  40.83 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  40.83 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  40.83 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  40.83 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  40.83 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  42.92 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  39.73 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  41.78 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  43.66 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  42.65 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  43.19 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  43.19 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  42.65 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  43.81 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  43.06 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3012  surface presentation of antigens protein SpaP  43.58 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3080  surface presentation of antigens protein SpaP  43.58 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.833245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3200  surface presentation of antigens protein SpaP  43.58 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3095  surface presentation of antigens protein SpaP  43.58 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3043  surface presentation of antigens protein SpaP  43.58 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  43 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  42.79 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  41.83 
 
 		 311 aa  166  2e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  39.91 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  41.78 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  42.31 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  42.03 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  38.79 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  40.57 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  38.79 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  42.03 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  38.79 
 
 		 255 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  40.19 
 
 		 257 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  39.64 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  38.79 
 
 		 251 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  40.57 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  42.31 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  40.38 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  39.91 
 
 		 250 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  38.6 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  40.27 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  39.71 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  42.93 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  42.93 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  40.2 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  41.35 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  42.21 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  45.92 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  39.42 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>