More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1691 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 255 aa  493  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  95.69 
 
 		 254 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  87.45 
 
 		 254 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  88 
 
 		 251 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  85.66 
 
 		 251 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  85.49 
 
 		 254 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  88.34 
 
 		 234 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  70.31 
 
 		 283 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  66.67 
 
 		 251 aa  315  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  69.47 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  69.37 
 
 		 253 aa  307  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  69.23 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  68.72 
 
 		 255 aa  305  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  60.58 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  58.72 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  63.76 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  56.03 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  55.16 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  55.2 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  58.18 
 
 		 223 aa  248  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  56.68 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  52.63 
 
 		 245 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  55.4 
 
 		 262 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  51.97 
 
 		 246 aa  244  8e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  57.27 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  56.16 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  53.88 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  59.47 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  57.67 
 
 		 253 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  57.67 
 
 		 253 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  57.67 
 
 		 253 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  52.81 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  56.81 
 
 		 265 aa  241  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  52.94 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 		 253 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  57.01 
 
 		 254 aa  241  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  53.45 
 
 		 247 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  50.62 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  52.34 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  56.86 
 
 		 222 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  58.33 
 
 		 222 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  56.74 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  52.81 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  53.65 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  56.54 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  55.91 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  53.42 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  56.4 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  56.73 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  56.81 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  50.22 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  54.67 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  52.46 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  53.05 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  55.14 
 
 		 276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  55.4 
 
 		 264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  56.07 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  51.58 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  54.67 
 
 		 276 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  54.67 
 
 		 276 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  53.11 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  53.14 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  56.07 
 
 		 277 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  53.88 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  53.74 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  47.95 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  53.74 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  53.88 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  52.58 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  52.58 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  53.67 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  48.55 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  48.55 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  50.81 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  47.54 
 
 		 245 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  48.96 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  47.52 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  49.37 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 		 249 aa  232  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  58.73 
 
 		 262 aa  231  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  53.17 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  55.19 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  52.86 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  46.34 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  53.52 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  56.07 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  49.39 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  49.39 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  49.39 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  47.48 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  47.48 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  47.48 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  52.63 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  49.39 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  52.42 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  47.48 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>