More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0264 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 245 aa  480  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  75.82 
 
 		 245 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  76.23 
 
 		 245 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  75.82 
 
 		 245 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  70.48 
 
 		 246 aa  322  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  70.42 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  67.41 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  67.41 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  68.87 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  63.2 
 
 		 253 aa  297  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  64.04 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  64.04 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  64.89 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  66.51 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  56.97 
 
 		 245 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  62.62 
 
 		 247 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  56.17 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  51.1 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  49.39 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  50.87 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  52.61 
 
 		 253 aa  238  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  52.61 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  51.87 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  50.21 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  54.07 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  48.57 
 
 		 254 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  52.36 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  51.07 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  52.36 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  53.11 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  50.94 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  51.4 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  57.82 
 
 		 264 aa  225  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  52.53 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  45.9 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  50.66 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  51.18 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  46.93 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  46.93 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  46.93 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  41.94 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  52.5 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  52.5 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  52.5 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  46.83 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  44.59 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  47.32 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  50.24 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  50.75 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  46.02 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  45.93 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  46.93 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  45.93 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1634  flagellar biosynthetic protein FliP  52.58 
 
 		 337 aa  208  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.296967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  48.08 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  46.43 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  46.43 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  42.68 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  43.21 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  43.1 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  43.1 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  43.97 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  43.97 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  45.05 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  44.35 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  51.44 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  45 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  48.65 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  44.58 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  46.08 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  45.98 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  46.38 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  46.32 
 
 		 277 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  42.29 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  44.16 
 
 		 289 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  45.89 
 
 		 279 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  41.6 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  44.09 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  45.37 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  44.09 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  44.09 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  44.09 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  44.09 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  44.09 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  44.25 
 
 		 253 aa  201  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  45.05 
 
 		 251 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  45.05 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  43.33 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  43.69 
 
 		 299 aa  201  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  48.04 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>