More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1700 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 
245 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
245 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  99.59 
 
 
245 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  99.59 
 
 
245 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
245 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
245 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  99.18 
 
 
245 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  91.84 
 
 
245 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  91.84 
 
 
245 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  91.84 
 
 
245 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  91.84 
 
 
245 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  91.43 
 
 
245 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  90.61 
 
 
245 aa  431  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  83.55 
 
 
274 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  81.51 
 
 
258 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  83.55 
 
 
274 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  85.27 
 
 
274 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  78.81 
 
 
254 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1881  flagellar biosynthesis protein FliP  79.49 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2585  flagellar biosynthesis protein FliP  79.91 
 
 
258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  75.88 
 
 
264 aa  349  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  73.99 
 
 
265 aa  344  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  72.97 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  71.23 
 
 
250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 
253 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 
253 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 
253 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 
253 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  72.65 
 
 
249 aa  321  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  64.78 
 
 
279 aa  321  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  64 
 
 
277 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  68.33 
 
 
276 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  63.87 
 
 
281 aa  316  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  67.87 
 
 
276 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  67.87 
 
 
276 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  67.42 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  71.09 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  66.06 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  66.06 
 
 
253 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  66.06 
 
 
253 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  60.73 
 
 
249 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  60.73 
 
 
249 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24130  flagellar biosynthetic protein  76.15 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  66.53 
 
 
262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  68.3 
 
 
253 aa  295  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  62.33 
 
 
262 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  64.13 
 
 
254 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  57.72 
 
 
262 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0763  flagellar biosynthesis protein FliP  64 
 
 
248 aa  285  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.49516  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  60.09 
 
 
261 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 
260 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  62.38 
 
 
251 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  61.9 
 
 
251 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  58.82 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  52.85 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  59.28 
 
 
251 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  60.63 
 
 
261 aa  269  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  59.73 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  58.82 
 
 
251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  58.82 
 
 
251 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  59.01 
 
 
252 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  62.86 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  55.61 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  58.12 
 
 
250 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  63.33 
 
 
255 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 
248 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 
248 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 
248 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 
248 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  58.82 
 
 
250 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  51.82 
 
 
255 aa  259  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  51.22 
 
 
249 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  55.14 
 
 
247 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  54.3 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2686  flagellar biosynthesis protein FliP  69.77 
 
 
175 aa  258  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  59.72 
 
 
246 aa  258  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  53.39 
 
 
248 aa  258  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  53.39 
 
 
248 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  53.39 
 
 
247 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  53.39 
 
 
248 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  52.94 
 
 
248 aa  255  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  57.64 
 
 
253 aa  255  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  50.64 
 
 
253 aa  254  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  57.55 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  51.74 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  50.41 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2910  flagellar biosynthesis protein FliP  62.44 
 
 
257 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.322895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  51.45 
 
 
245 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  54.87 
 
 
246 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  58.22 
 
 
278 aa  244  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  52.63 
 
 
252 aa  244  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 
257 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  52.04 
 
 
289 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  51.57 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  53.66 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  52.42 
 
 
251 aa  238  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  52.04 
 
 
299 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1753  flagellar biosynthesis protein FliP  55.51 
 
 
249 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1753  flagellar biosynthesis protein FliP  55.51 
 
 
249 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  51.13 
 
 
289 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>