More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0033 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  71.43 
 
 
246 aa  353  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  73.64 
 
 
262 aa  337  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  65.83 
 
 
246 aa  329  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  65.83 
 
 
246 aa  329  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  73.18 
 
 
253 aa  329  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  72.73 
 
 
260 aa  328  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  72.73 
 
 
260 aa  328  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  66.81 
 
 
246 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  66.38 
 
 
245 aa  321  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  62.35 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  66.52 
 
 
248 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  66.09 
 
 
246 aa  305  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  60.33 
 
 
245 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  59.84 
 
 
245 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  59.18 
 
 
245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  62.62 
 
 
245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  52.81 
 
 
253 aa  245  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  50.4 
 
 
251 aa  244  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  53.77 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
254 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  53.99 
 
 
251 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  52.04 
 
 
234 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  53.77 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  52.4 
 
 
251 aa  242  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  51.24 
 
 
254 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  54.93 
 
 
255 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  51.3 
 
 
283 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  52.43 
 
 
248 aa  238  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 
264 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  52.36 
 
 
255 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  51.77 
 
 
254 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  51.66 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  45.78 
 
 
248 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  45.78 
 
 
248 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  47.79 
 
 
266 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  45.78 
 
 
248 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  45.78 
 
 
248 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  52.63 
 
 
256 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  51.57 
 
 
255 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  50.67 
 
 
250 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  50.9 
 
 
251 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  50.47 
 
 
248 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  46.52 
 
 
266 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
247 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  49.57 
 
 
247 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  50.73 
 
 
252 aa  222  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  44.49 
 
 
247 aa  221  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  48.58 
 
 
248 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  48.58 
 
 
248 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  48.58 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  48.58 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  48.13 
 
 
249 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  45.37 
 
 
252 aa  215  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  45.7 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  46.64 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  45.53 
 
 
243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 
244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 
244 aa  211  7e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  48.83 
 
 
253 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  51.53 
 
 
222 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  48.77 
 
 
244 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
253 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
253 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
253 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  43.1 
 
 
248 aa  208  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  46.01 
 
 
253 aa  207  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  43.87 
 
 
248 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3565  flagellar biosynthesis protein FliP  46.78 
 
 
260 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.809512  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  44.23 
 
 
262 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  49.53 
 
 
261 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  49.29 
 
 
281 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 
253 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  46.01 
 
 
265 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  46.26 
 
 
253 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 
253 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  47.78 
 
 
257 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  40.94 
 
 
248 aa  204  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
249 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  49.03 
 
 
222 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
249 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 
253 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  45.5 
 
 
241 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  48.11 
 
 
251 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  43.78 
 
 
254 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  47.42 
 
 
262 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  47.17 
 
 
249 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  47.64 
 
 
251 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  45.07 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  45.57 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  48.17 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  44.91 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  42.74 
 
 
258 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  43.69 
 
 
238 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  45.58 
 
 
253 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  44.13 
 
 
262 aa  198  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>