More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3824 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 247 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  98.38 
 
 		 247 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  86.72 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  85.97 
 
 		 255 aa  391  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  82.82 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  76.99 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  74.56 
 
 		 257 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  57.55 
 
 		 248 aa  292  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  56.61 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  60.54 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  63.51 
 
 		 223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  58.09 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  57.73 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  63.64 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  58.65 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  57.02 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  61.72 
 
 		 222 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  59.23 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  55.26 
 
 		 231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  58.95 
 
 		 317 aa  265  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  56.58 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  56.6 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  57.14 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  56.39 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  60 
 
 		 221 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  53.2 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  56.5 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  53.88 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  53.72 
 
 		 253 aa  257  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  64.93 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  55.36 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  56.17 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  55.8 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  56.25 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  53.97 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  53.97 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  53.97 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  54.71 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  53.97 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  58.65 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  54.77 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  58.65 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  54.71 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  54.84 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  53.31 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  53.14 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  55.22 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  52.48 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  52.48 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  52.72 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  54.26 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  55.22 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  57.42 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  51.85 
 
 		 262 aa  251  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0865  flagellar biosynthesis protein FliP  63.29 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  54.78 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  54.36 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  54.58 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  49.2 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  51.03 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  52.3 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  50.61 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  53.06 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  56.59 
 
 		 253 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  55.42 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  51.98 
 
 		 244 aa  248  9e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  53.81 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  56.25 
 
 		 281 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  54.08 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  58.33 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  60.32 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  53.91 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  55.2 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  56.76 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  55.2 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  53.31 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  54.26 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  54.75 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  57.97 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  57.07 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  54.81 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  57.28 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  52.56 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  55.09 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  52.23 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  56.94 
 
 		 213 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  55.07 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  55.66 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  56.22 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  51.48 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  54.81 
 
 		 289 aa  240  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  57.07 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  58.2 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  57.92 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  52.32 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  57.56 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  52.32 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  52.32 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>