More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3097 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
250 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  89.59 
 
 
255 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  82.83 
 
 
251 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  82.4 
 
 
247 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  82.33 
 
 
247 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  76.57 
 
 
256 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  76.32 
 
 
257 aa  357  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  63.04 
 
 
248 aa  299  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  58.77 
 
 
257 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  63.06 
 
 
252 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  57.81 
 
 
256 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  57.94 
 
 
252 aa  285  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  65.07 
 
 
222 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 
222 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  55.91 
 
 
254 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  59.91 
 
 
247 aa  275  7e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  56 
 
 
231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  55.73 
 
 
260 aa  270  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  60.81 
 
 
223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  65.79 
 
 
255 aa  269  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  53.31 
 
 
245 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  57.08 
 
 
244 aa  267  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  65 
 
 
259 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  59.83 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  55.75 
 
 
244 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  55.31 
 
 
244 aa  261  6e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  56.95 
 
 
261 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  55.02 
 
 
251 aa  260  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  54.87 
 
 
244 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  55.98 
 
 
248 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  59.07 
 
 
221 aa  258  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  59.62 
 
 
280 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  53.45 
 
 
260 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  54.81 
 
 
262 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  52.87 
 
 
244 aa  255  5e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  56.05 
 
 
252 aa  254  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  55.6 
 
 
250 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  51.54 
 
 
266 aa  254  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  55.42 
 
 
254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  56.5 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  55.17 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  53.88 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  50.61 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  58.9 
 
 
264 aa  251  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  51 
 
 
249 aa  251  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  55.4 
 
 
289 aa  251  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  51.08 
 
 
247 aa  251  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  50.61 
 
 
248 aa  251  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  54.59 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  50.86 
 
 
248 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  56.07 
 
 
289 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  58.65 
 
 
255 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  51.54 
 
 
248 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
255 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  58.17 
 
 
255 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  52.84 
 
 
238 aa  249  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  53.42 
 
 
245 aa  248  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  48.8 
 
 
248 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  48.8 
 
 
248 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  53.85 
 
 
253 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  56.94 
 
 
251 aa  248  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  54.29 
 
 
266 aa  248  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  51.77 
 
 
248 aa  248  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  58.37 
 
 
213 aa  248  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  54.71 
 
 
251 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  54.71 
 
 
255 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  49.36 
 
 
247 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  48.4 
 
 
248 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  48.4 
 
 
248 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  50.4 
 
 
254 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 
251 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 
251 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  52.4 
 
 
250 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  54.74 
 
 
251 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  56.36 
 
 
234 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 
289 aa  245  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  54.19 
 
 
243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  54.74 
 
 
283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  51.65 
 
 
253 aa  244  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  54.3 
 
 
253 aa  244  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  53.85 
 
 
255 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0865  flagellar biosynthesis protein FliP  62.82 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  54.3 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  56.16 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  52.23 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  54.55 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  55.25 
 
 
253 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  49.01 
 
 
293 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  57.01 
 
 
251 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  56.62 
 
 
265 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  52.17 
 
 
261 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  53.78 
 
 
254 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
253 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  49.37 
 
 
249 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  56.54 
 
 
251 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  55.26 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0377  flagellar biosynthesis protein FliP  56.05 
 
 
225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  58.73 
 
 
253 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  51.02 
 
 
246 aa  238  5e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>