More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3056 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 248 aa  487  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  86.29 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  83.06 
 
 		 255 aa  410  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  81.38 
 
 		 249 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  81.22 
 
 		 248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  81.22 
 
 		 248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  80.82 
 
 		 248 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  80.82 
 
 		 248 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  80.97 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  80.57 
 
 		 248 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  80.57 
 
 		 248 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  80.16 
 
 		 248 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  78.6 
 
 		 253 aa  387  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  80.42 
 
 		 248 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  83.04 
 
 		 249 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  79.31 
 
 		 247 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  65.32 
 
 		 255 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  67.4 
 
 		 289 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  64.41 
 
 		 251 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  61.85 
 
 		 252 aa  315  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  67.11 
 
 		 289 aa  314  9e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  64.41 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  61.02 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  63.96 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  65.93 
 
 		 289 aa  312  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  63.96 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  66.67 
 
 		 299 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  64.25 
 
 		 255 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  65.32 
 
 		 280 aa  310  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  63.51 
 
 		 250 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  65.47 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  62.9 
 
 		 255 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  61.88 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  65.16 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  63.32 
 
 		 251 aa  297  9e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  61.76 
 
 		 247 aa  289  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  57.63 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  57.63 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  57.63 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  59.83 
 
 		 245 aa  287  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  55.73 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  58.77 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  58.33 
 
 		 277 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  59.91 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  60.18 
 
 		 276 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  59.73 
 
 		 253 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  59.28 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  59.28 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  59.46 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  59.28 
 
 		 253 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  58.82 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  58.68 
 
 		 262 aa  274  7e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  61.67 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  54.51 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  56.19 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  52.85 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  52.85 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  52.85 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  52.85 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  52.44 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  52.44 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  57.92 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  56.11 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  59.01 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  52.03 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  52.63 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  53.97 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  53.97 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  56.73 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  55.41 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  51.22 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  51.22 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  57.62 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  56.82 
 
 		 249 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  54.89 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  55.75 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  53.14 
 
 		 254 aa  261  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  55.31 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  56.13 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  56.31 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1168  flagellar biosynthetic protein FliP  58.93 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.655036  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  52.14 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  52.14 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  56.31 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  55.09 
 
 		 260 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0763  flagellar biosynthesis protein FliP  58.48 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.49516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  55.2 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  55.92 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  55.2 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  52.97 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0740  flagellar biosynthesis protein FliP  61.86 
 
 		 252 aa  251  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2585  flagellar biosynthesis protein FliP  53.56 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  51.03 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0710  flagellar biosynthesis protein FliP  61.99 
 
 		 274 aa  250  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1753  flagellar biosynthesis protein FliP  58.56 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>