More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2568 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  67.41 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  64.6 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  63.87 
 
 		 251 aa  308  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  67.71 
 
 		 266 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  64.6 
 
 		 283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  64.29 
 
 		 255 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  64.13 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  63.16 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  62.18 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  64.25 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  61.83 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  63.35 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  59.58 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  63.01 
 
 		 254 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  60.55 
 
 		 255 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  57.99 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  59.41 
 
 		 252 aa  254  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  58.45 
 
 		 247 aa  254  9e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  54.87 
 
 		 266 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  61.08 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  53.31 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  56.62 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  53.71 
 
 		 246 aa  248  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  60.89 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  59.31 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  55.7 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  58.33 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  55.19 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  55.66 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  55.66 
 
 		 260 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  54.93 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  57.84 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  50.45 
 
 		 253 aa  242  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  52.89 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  58.33 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 		 222 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  57.92 
 
 		 222 aa  241  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  57.84 
 
 		 244 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  51.1 
 
 		 245 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  57.84 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  48.77 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  53.74 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  50.22 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  51.5 
 
 		 245 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  52.43 
 
 		 247 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  51.72 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  50.66 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  52.72 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  58.73 
 
 		 253 aa  234  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  49.59 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  56.36 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  61.39 
 
 		 223 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  52.72 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  50.42 
 
 		 245 aa  232  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 		 248 aa  231  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  52.8 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  52.8 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  52.8 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  49.38 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  52.8 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 289 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  51.95 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  49.12 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  51.22 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  57.42 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  51.87 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  52.48 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  51.87 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  51.87 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  51.87 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  50.2 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  55.26 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  51.1 
 
 		 247 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  50.2 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  50.2 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  50.4 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  47.48 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  49 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  54.95 
 
 		 244 aa  228  9e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  48.7 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  53.68 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  51.96 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  49 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  51.12 
 
 		 236 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  50.2 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  51.85 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  54.41 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  48.03 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  52.56 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  56.32 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  54.29 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>