More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1103 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  72.89 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  69.83 
 
 		 245 aa  344  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  66.94 
 
 		 253 aa  341  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  69.3 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  69.3 
 
 		 260 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  66.38 
 
 		 247 aa  328  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  65.82 
 
 		 246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  67.51 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  67.51 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  68.56 
 
 		 246 aa  322  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  67.27 
 
 		 247 aa  309  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  66.51 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  64.76 
 
 		 246 aa  301  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  58.87 
 
 		 245 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  58.87 
 
 		 245 aa  284  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  59.41 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  57.42 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  55.87 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  55.87 
 
 		 253 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  54.15 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  53.39 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  55.2 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  61.54 
 
 		 264 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  53.78 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  53.47 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  55.46 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  53.33 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  55.87 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  53.36 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  53.71 
 
 		 283 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  53.55 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  54.67 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  47.98 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  51.45 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  50.68 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  51.46 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  51.74 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  52.43 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  51.21 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  51.71 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  52.43 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  51.94 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  44.18 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  51.16 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  45.53 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  45.22 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  51.01 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  42.32 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  46.12 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  42.32 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  42.32 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  42.32 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  45.11 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  42.29 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  45.11 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  49.07 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  43.62 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  48.58 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  44.1 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  43.21 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  44.58 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  44.58 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.58 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  44.58 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  45.82 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  45.04 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  44.84 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  43.6 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  43.17 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  45.04 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  45.29 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  43.17 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  42.54 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  43.17 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  43.17 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  43.17 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  43.17 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  43.5 
 
 		 289 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  43.17 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  44.62 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  49.31 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  42.54 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  42.54 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  42.54 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  48.84 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  41.08 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  45.74 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  44.27 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  45.74 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  44.75 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  46.64 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  47.79 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  49.48 
 
 		 221 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  43.16 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  42.98 
 
 		 253 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>