More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3267 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 242 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  63.27 
 
 		 248 aa  297  8e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  66.22 
 
 		 239 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  65.5 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  64.73 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  63.27 
 
 		 236 aa  284  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  60.58 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  45.61 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  45.3 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  48.88 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  46.96 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  47.3 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  46.91 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  47.11 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  47.53 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  47.48 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  47.6 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  48.43 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  44.86 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  44.86 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  46.49 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 		 262 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  47.77 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  50.49 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  43.25 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 		 260 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  46.19 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  45.95 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  46.05 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  46.05 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  44.08 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  46.22 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  48.84 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  45.28 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  46.75 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  48.78 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  43.53 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  44.78 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  47.24 
 
 		 222 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  41.48 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  43.58 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  47.24 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  48.58 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  45.33 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  45.29 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  43.58 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  42.15 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  42.15 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  41.57 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  42.6 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  43.44 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  42.15 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  45.21 
 
 		 248 aa  187  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  42.38 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  45.87 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  46.08 
 
 		 279 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  44.35 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  47 
 
 		 289 aa  185  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  43.91 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  45.16 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  45.16 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  43.33 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  41.56 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  45.16 
 
 		 253 aa  184  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 248 aa  184  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  43.58 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  40.24 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  47.37 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  46.98 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  43.15 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  44.19 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  44.19 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.19 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  44.44 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  44.7 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  44.7 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  40.37 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  42.41 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  44.7 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  44.7 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  41.7 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  41.07 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  42.41 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  46.51 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  44.44 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.8 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  45.83 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  44.7 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>