More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0962 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 		 277 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  61.09 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  62.39 
 
 		 287 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0857  flagellar biosynthesis protein FliP  63.2 
 
 		 318 aa  266  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  56.9 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  56.56 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31060  flagellar biosynthetic protein FliP  57.38 
 
 		 283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  44.93 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  54.5 
 
 		 248 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  48.89 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  45.66 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  51.46 
 
 		 222 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  54.21 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  49.77 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  53.08 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0743  flagellar biosynthesis protein FliP  59.74 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  53.55 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  53.05 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  50.73 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 251 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  50.46 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  52.13 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  47.06 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 		 251 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  47.96 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  51.66 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  47.41 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  53.52 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  51.66 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  57.67 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  50.5 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  47.53 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 		 251 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  49.34 
 
 		 252 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  47.22 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  47 
 
 		 257 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  50.22 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  45.71 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  50.68 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  51.05 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  53.81 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  48.44 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  51.18 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  45.57 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  51.44 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  48.9 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  53.16 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  51.94 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  46.18 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  47.87 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  46.58 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  46.58 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 234 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 		 252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  48.58 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  49.11 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  46.12 
 
 		 253 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  46.15 
 
 		 260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  46.72 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  47.22 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0155  flagellar biosynthetic protein FliP  51.2 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  48.51 
 
 		 221 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  49.32 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  48.87 
 
 		 255 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  48.42 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  49.09 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  48.34 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1634  flagellar biosynthetic protein FliP  49.74 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.296967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  45.19 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  50.95 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  46.3 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  51.1 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 		 253 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  51.4 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  43.08 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  43.08 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  43.08 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  43.08 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  46.88 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  46.88 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>