More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2162 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
262 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  63.56 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  63.56 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  63.56 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  63.56 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  64.73 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  62.82 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  59.92 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  62.3 
 
 
248 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  63.68 
 
 
248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  63.68 
 
 
248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  60.16 
 
 
253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  63.4 
 
 
248 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  61.44 
 
 
248 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  60.25 
 
 
249 aa  298  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  59.6 
 
 
249 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  61.02 
 
 
245 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  62.56 
 
 
248 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  62.56 
 
 
261 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  62.4 
 
 
253 aa  297  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  63.75 
 
 
247 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  61.71 
 
 
251 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  61.8 
 
 
251 aa  295  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  61.71 
 
 
251 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  62.72 
 
 
247 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  63.51 
 
 
289 aa  292  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  61.54 
 
 
255 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  62.61 
 
 
255 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  61.71 
 
 
250 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  61.26 
 
 
251 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  62.16 
 
 
255 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  61.3 
 
 
250 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  61.26 
 
 
252 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  62.44 
 
 
299 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  63.06 
 
 
289 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  62.16 
 
 
289 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  60.35 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  62.61 
 
 
253 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  59.83 
 
 
279 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  60 
 
 
253 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  60 
 
 
253 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  60 
 
 
253 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  60 
 
 
253 aa  278  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  61.71 
 
 
253 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  61.71 
 
 
253 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  57.26 
 
 
281 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  60.81 
 
 
253 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  60.71 
 
 
277 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  60.81 
 
 
276 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  61.26 
 
 
276 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  60.81 
 
 
276 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0710  flagellar biosynthesis protein FliP  66.38 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  56.02 
 
 
252 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1168  flagellar biosynthetic protein FliP  62.28 
 
 
256 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.655036  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  62.22 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  57.47 
 
 
265 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  58.04 
 
 
246 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  59.43 
 
 
250 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0740  flagellar biosynthesis protein FliP  63.18 
 
 
252 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  56.58 
 
 
278 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  58.18 
 
 
301 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  58.18 
 
 
301 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  58.23 
 
 
262 aa  259  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  57.46 
 
 
254 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  58.69 
 
 
274 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  56.7 
 
 
264 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  58.69 
 
 
274 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  59.21 
 
 
246 aa  258  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  54.36 
 
 
245 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  54.36 
 
 
245 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  54.36 
 
 
245 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  54.36 
 
 
245 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  54.36 
 
 
245 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  55.84 
 
 
249 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  55.84 
 
 
249 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  57.78 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  56.31 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  58.06 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801028  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  55.41 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  57.55 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1753  flagellar biosynthesis protein FliP  56.47 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  57.55 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  57.55 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  57.55 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  57.55 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  55.7 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  57.55 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1753  flagellar biosynthesis protein FliP  56.47 
 
 
249 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  56.48 
 
 
254 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  57.08 
 
 
245 aa  251  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  54.02 
 
 
253 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  55.02 
 
 
262 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  50.61 
 
 
258 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  53.16 
 
 
252 aa  247  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  57.85 
 
 
253 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  52.16 
 
 
261 aa  244  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  54.63 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  54.22 
 
 
255 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  54.17 
 
 
251 aa  241  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  50.21 
 
 
262 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>