More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3681 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 255 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  98.67 
 
 		 251 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  91.76 
 
 		 251 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  97.78 
 
 		 251 aa  430  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  88.66 
 
 		 250 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  91.11 
 
 		 250 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  88.6 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  84.65 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  83.77 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  83.33 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  69.47 
 
 		 280 aa  333  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  64.88 
 
 		 248 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  64.88 
 
 		 248 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  64.88 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  64.88 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  66.53 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  65.68 
 
 		 255 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  64.34 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  61.73 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  64.85 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  65.4 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  65.4 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  65.4 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  67.23 
 
 		 245 aa  318  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  68.47 
 
 		 299 aa  316  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  68.61 
 
 		 251 aa  315  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  63.22 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  63.95 
 
 		 248 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  67.42 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  64.86 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  65.24 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  59.68 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  66.67 
 
 		 289 aa  308  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  66.67 
 
 		 289 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  65.96 
 
 		 253 aa  304  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  58.23 
 
 		 252 aa  301  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  61.54 
 
 		 262 aa  292  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  62.55 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  61.23 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  59.49 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  59.92 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  61.71 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  58.06 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  58.06 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  58.06 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  59.66 
 
 		 253 aa  278  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  61.99 
 
 		 253 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  62.45 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  61.09 
 
 		 276 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  61.09 
 
 		 276 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  61.54 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  60.63 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  61.09 
 
 		 277 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  60.18 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  58.82 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  60.63 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  59.91 
 
 		 265 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  60.68 
 
 		 250 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  59.91 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1753  flagellar biosynthesis protein FliP  59.05 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1753  flagellar biosynthesis protein FliP  59.05 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  272  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  272  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  56.68 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  56.68 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  58.97 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  58.55 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  58.05 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  61.19 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  56.6 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  59.82 
 
 		 251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  60.45 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  59.36 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  56.68 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  57.2 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  55.69 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  56.58 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  56.14 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  60.95 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  61.79 
 
 		 278 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  60.95 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  60.95 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  60.95 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  60.95 
 
 		 245 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  58.56 
 
 		 301 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  60.48 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  58.56 
 
 		 301 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  54.39 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  54.22 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  58.77 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  56.17 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  56.17 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  58.77 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  55.1 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  52.26 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  54.55 
 
 		 246 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>