More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0584 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 
252 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  60.66 
 
 
248 aa  296  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  58.87 
 
 
251 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  61.43 
 
 
247 aa  288  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  63.06 
 
 
250 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  60.54 
 
 
247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  62.16 
 
 
256 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  61.64 
 
 
255 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  60.81 
 
 
257 aa  279  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  55.46 
 
 
231 aa  272  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  58.65 
 
 
254 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  53.25 
 
 
257 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  62.86 
 
 
222 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 
252 aa  265  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  63.33 
 
 
222 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  56.36 
 
 
256 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  56 
 
 
260 aa  257  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  59.19 
 
 
223 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  59.41 
 
 
248 aa  254  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  57.28 
 
 
234 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  51.8 
 
 
244 aa  248  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  50.22 
 
 
244 aa  248  7e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  52.99 
 
 
260 aa  248  8e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  56.81 
 
 
254 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  51.8 
 
 
244 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  51.8 
 
 
244 aa  248  9e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  61.03 
 
 
259 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  53.3 
 
 
289 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  52.34 
 
 
261 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  53.88 
 
 
280 aa  246  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  51.53 
 
 
244 aa  246  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  54.71 
 
 
247 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  48.03 
 
 
266 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  62.96 
 
 
255 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  56.68 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  51.56 
 
 
251 aa  245  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  52.4 
 
 
289 aa  244  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  55.91 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  58.62 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  52.84 
 
 
262 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  53.42 
 
 
251 aa  241  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  53.81 
 
 
255 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  49.6 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
252 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  53.54 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  50.67 
 
 
245 aa  240  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 
317 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  56.32 
 
 
281 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  53.42 
 
 
299 aa  240  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  53.54 
 
 
251 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3565  flagellar biosynthesis protein FliP  55.07 
 
 
260 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.809512  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  52.97 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  56.02 
 
 
221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
248 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
248 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
248 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
248 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  51.56 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  58.2 
 
 
262 aa  238  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  58.25 
 
 
213 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  52.47 
 
 
250 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0377  flagellar biosynthesis protein FliP  56.82 
 
 
225 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  52.78 
 
 
247 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  52.47 
 
 
250 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  50.66 
 
 
251 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  52.78 
 
 
248 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  52.51 
 
 
255 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
266 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  51.79 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  51.79 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  52.78 
 
 
248 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  57.92 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  53.91 
 
 
262 aa  235  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  52.02 
 
 
251 aa  235  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  48.4 
 
 
248 aa  234  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  51.8 
 
 
248 aa  234  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  52.81 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  53.99 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  53.27 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  54.46 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  53.27 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  50.68 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  54.46 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  54.46 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  53.27 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  53.2 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2215  flagellar biosynthesis protein FliP  56.36 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  53.2 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  53.52 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  52.25 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0186  flagellar biosynthetic protein FliP  49.38 
 
 
262 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.14334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  53.99 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  53.99 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  53.99 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  57.43 
 
 
251 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  50.23 
 
 
253 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  50.23 
 
 
253 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  50.23 
 
 
253 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>