More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0029 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  95.65 
 
 		 253 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  94.86 
 
 		 253 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  94.86 
 
 		 253 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  94.86 
 
 		 253 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  94.86 
 
 		 253 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  90.12 
 
 		 276 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  89.72 
 
 		 276 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  89.72 
 
 		 276 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  88.31 
 
 		 279 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  89.33 
 
 		 253 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  90.91 
 
 		 277 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  81.64 
 
 		 281 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  72.97 
 
 		 265 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  70.48 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  71.37 
 
 		 250 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  69.37 
 
 		 253 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2686  flagellar biosynthesis protein FliP  91.38 
 
 		 175 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  63.16 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 		 245 aa  318  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 		 245 aa  318  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  66.81 
 
 		 245 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  66.81 
 
 		 245 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  66.81 
 
 		 245 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  62.75 
 
 		 245 aa  316  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  66.81 
 
 		 245 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  66.81 
 
 		 245 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  71.13 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  63.75 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  64.49 
 
 		 258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  65.35 
 
 		 245 aa  311  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  68.33 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  68.86 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2585  flagellar biosynthesis protein FliP  67.21 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  65.47 
 
 		 274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  65.47 
 
 		 274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  64.83 
 
 		 249 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  64.83 
 
 		 249 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  62.07 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1881  flagellar biosynthesis protein FliP  66.13 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  62.4 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  64.46 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  61.9 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  59.23 
 
 		 255 aa  291  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0763  flagellar biosynthesis protein FliP  67.56 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.49516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  63.64 
 
 		 262 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  55.87 
 
 		 248 aa  285  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  60.08 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  58.77 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  58.77 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  58.77 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  58.77 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  60.18 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  62.72 
 
 		 251 aa  281  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  56.72 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  64.45 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  61.61 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  55.98 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  57.02 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  61.54 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  60.36 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  59.41 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  60.36 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  59.91 
 
 		 251 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  59.91 
 
 		 251 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  56.58 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 		 248 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 		 248 aa  271  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  59.91 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  59.73 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  56.05 
 
 		 280 aa  268  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  56.11 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  58.56 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  58.85 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  58.56 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24130  flagellar biosynthetic protein  66.11 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  55.13 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  56.71 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  62.09 
 
 		 278 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  58.11 
 
 		 250 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2910  flagellar biosynthesis protein FliP  66.67 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.322895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  54.11 
 
 		 289 aa  258  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  55.51 
 
 		 289 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  53.5 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  57.73 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  57.73 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  55.2 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  53.7 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  57.99 
 
 		 234 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  52.94 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  56.62 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  56.47 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>