More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0560 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 260 aa  501  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  78.93 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  82.97 
 
 		 251 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  82.53 
 
 		 251 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  81.22 
 
 		 261 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  79.57 
 
 		 262 aa  358  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  76.92 
 
 		 254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  67.56 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  62.24 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  62.24 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  65.3 
 
 		 250 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  63.4 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  59.59 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  59.59 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  61.07 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  61.07 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  61.07 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  60.66 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  64.93 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  59.15 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  64.79 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  64.79 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  62.56 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  62.56 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  58.47 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  60.79 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  65.12 
 
 		 265 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  60.79 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  60.79 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  60.79 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  60.79 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  64.32 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  62.09 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  60.53 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  59.83 
 
 		 277 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  64.32 
 
 		 276 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  63.85 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  64.11 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  59.39 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  63.85 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0763  flagellar biosynthesis protein FliP  65.04 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.49516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  64.61 
 
 		 262 aa  271  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  61.47 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  63.38 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  64.19 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  57.27 
 
 		 281 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  58.88 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  51.53 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  60.47 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  59.81 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1881  flagellar biosynthesis protein FliP  63.64 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  59.53 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  54.24 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2585  flagellar biosynthesis protein FliP  63.64 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  61.03 
 
 		 249 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  55.11 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  58.8 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  52.07 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  56.94 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  55.09 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  55.45 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  59.42 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  57.87 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  51.65 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  51.65 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  51.65 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  51.65 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  52.1 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  51.48 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  57.41 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  53.62 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  50.65 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  50.65 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  50.65 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  54.59 
 
 		 247 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  55.56 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  52 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  53.74 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  56.13 
 
 		 278 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  56.93 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  50.81 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  53.78 
 
 		 289 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24130  flagellar biosynthetic protein  64.77 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  51.45 
 
 		 246 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  48.57 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  56.07 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  56.04 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  55.5 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  50.66 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  54.63 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  56.6 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  57.07 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  56.02 
 
 		 255 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  55.81 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  54.76 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>