More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1390 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
251 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  94.02 
 
 
251 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  90.48 
 
 
254 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  91.89 
 
 
234 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  86.75 
 
 
254 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  91.4 
 
 
255 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  83.27 
 
 
254 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  66.53 
 
 
251 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  69.3 
 
 
283 aa  318  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  68 
 
 
253 aa  315  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  67.56 
 
 
253 aa  315  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  67.71 
 
 
253 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  67.26 
 
 
255 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  63.87 
 
 
248 aa  308  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  63.84 
 
 
251 aa  289  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  66.07 
 
 
266 aa  285  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  56.76 
 
 
252 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  58.59 
 
 
266 aa  254  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  58.37 
 
 
255 aa  254  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  56.41 
 
 
247 aa  254  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  58.18 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  54.78 
 
 
247 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  53.71 
 
 
246 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  59.36 
 
 
223 aa  250  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  52.23 
 
 
246 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  52.28 
 
 
251 aa  248  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  54.29 
 
 
253 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  54.29 
 
 
253 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  54.29 
 
 
253 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  54.11 
 
 
245 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  53.85 
 
 
253 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  60.18 
 
 
264 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  60.1 
 
 
222 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  56.34 
 
 
265 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  54.93 
 
 
262 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  57.08 
 
 
247 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  55.19 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  56.34 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  54.82 
 
 
257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  51.25 
 
 
248 aa  244  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  56.82 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  52.12 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  56.62 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  57.64 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  51.79 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  60.85 
 
 
253 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  56.48 
 
 
254 aa  242  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  54.25 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  57.64 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  53.42 
 
 
252 aa  241  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  54.79 
 
 
253 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  56.62 
 
 
253 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  51.26 
 
 
257 aa  241  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  51.04 
 
 
245 aa  241  9e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  53.52 
 
 
253 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  56.48 
 
 
251 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  56.4 
 
 
276 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  56.4 
 
 
276 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  56.48 
 
 
262 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  55.14 
 
 
246 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  55.05 
 
 
246 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  52.51 
 
 
244 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  56.87 
 
 
276 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  48.98 
 
 
245 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  55.14 
 
 
246 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  49.39 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  56.02 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  55.92 
 
 
250 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  53.05 
 
 
260 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  53.05 
 
 
260 aa  238  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  54.39 
 
 
277 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  58.73 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  52.73 
 
 
244 aa  238  8e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  50.21 
 
 
246 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  53.06 
 
 
249 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  52.02 
 
 
279 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  53.06 
 
 
249 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 
244 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  50.79 
 
 
262 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 
249 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 
248 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 
248 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 
248 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 
248 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  55.14 
 
 
274 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  55.14 
 
 
278 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  51.43 
 
 
254 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  52.03 
 
 
256 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  54.19 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  53.05 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
248 aa  232  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  53.95 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  52.65 
 
 
289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>