More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0747 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  80.82 
 
 		 245 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  80.82 
 
 		 245 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  75.82 
 
 		 245 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  72.81 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  61.45 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  65.5 
 
 		 246 aa  301  9e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  65.5 
 
 		 246 aa  301  9e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  65.07 
 
 		 246 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  60.57 
 
 		 246 aa  295  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  63.32 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  63.68 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  59.13 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  64.52 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  64.52 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  56.56 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  61.16 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  50.2 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  52.31 
 
 		 234 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  48.98 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  49.59 
 
 		 248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  48.9 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  51.71 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  51.22 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  46.72 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  48.58 
 
 		 283 aa  224  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  51.8 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  44.73 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  47.87 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  47.87 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  47.64 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  49.3 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  49.53 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  54.77 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  54.77 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  54.77 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  44.44 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  44.44 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.44 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  44.03 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  51.26 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  47.44 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  48.31 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  55.92 
 
 		 264 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  47.68 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  47.55 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  51.76 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  52.43 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  50.69 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  44.81 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  49.51 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  46.75 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  46.58 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  46.18 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  45.87 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  47.25 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  46.51 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  45.12 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  45.68 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  46.12 
 
 		 277 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  45.9 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  45.9 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  44.49 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 		 253 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  45.78 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  46.64 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  45.29 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  45.29 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  44.93 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  45.29 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  42.45 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  45.29 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  44.93 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  44.93 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  44.93 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  44.93 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  44.93 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  44.93 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  44.39 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  44.59 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  44.39 
 
 		 248 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  44.59 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  45.33 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  44.59 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  46.81 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  50.26 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>