More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0627 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  99.62 
 
 		 260 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  95.55 
 
 		 253 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  88.5 
 
 		 262 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  71.9 
 
 		 245 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  72.73 
 
 		 246 aa  344  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  67.74 
 
 		 246 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  67.74 
 
 		 246 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  69.33 
 
 		 247 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  71.82 
 
 		 246 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  70.85 
 
 		 248 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  67.36 
 
 		 247 aa  318  7e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  68.64 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  63.36 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  64.38 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  64.38 
 
 		 245 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  59.92 
 
 		 245 aa  288  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  55.4 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  51.85 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  53.05 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  49.22 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  53.05 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  55.19 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  52.58 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  53.52 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  53.52 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  53.52 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  50.97 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  51.64 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  53.27 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  52.58 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  52.83 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  52.11 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  58.6 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  53.43 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  53.43 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  53.43 
 
 		 244 aa  224  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  48.03 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  45.63 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  48.83 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  49.07 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  46.22 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  49.53 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  48.58 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  49.27 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  47.51 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  45.06 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  49.02 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  46.96 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  41.67 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  41.67 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  41.74 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  49.53 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  41.74 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  42.19 
 
 		 249 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  43.64 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  47.85 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  42.06 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  44.54 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  45.1 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  49.53 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 		 238 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  45.1 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  45.07 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  40.15 
 
 		 281 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  40.54 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  39.75 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  49.24 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  38.61 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  42.67 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  49.02 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  40.08 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  44.2 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  43.88 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  44.2 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  43.75 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  43.75 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  40.5 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  43.14 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  45.15 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  49.74 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  43.48 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  41.81 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  43.24 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>