More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2830 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
264 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  63.88 
 
 
253 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  61.63 
 
 
251 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  59.83 
 
 
248 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  64.13 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  63.96 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  60.17 
 
 
251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  59.74 
 
 
251 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  61.43 
 
 
254 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  62.95 
 
 
255 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  56.82 
 
 
254 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  62.56 
 
 
283 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  59.73 
 
 
234 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  58.3 
 
 
254 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  59.29 
 
 
251 aa  271  8.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  59.38 
 
 
255 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  60.63 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  57.21 
 
 
247 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  57.58 
 
 
245 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  59.15 
 
 
247 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  54.36 
 
 
246 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  58.48 
 
 
266 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  55.04 
 
 
246 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  54.36 
 
 
246 aa  260  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  58.6 
 
 
260 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  58.6 
 
 
260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  54.55 
 
 
251 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  52.87 
 
 
253 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  61.54 
 
 
248 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  54.74 
 
 
245 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  55.91 
 
 
253 aa  254  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  56.28 
 
 
246 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  55.51 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  54.82 
 
 
245 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  54.82 
 
 
245 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  57.27 
 
 
255 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  54.87 
 
 
266 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  56.11 
 
 
250 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  55.13 
 
 
247 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  55.6 
 
 
247 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  56.5 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  59.49 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  55.92 
 
 
245 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  49.17 
 
 
248 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  55.91 
 
 
257 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  58.88 
 
 
222 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  47.5 
 
 
248 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  47.5 
 
 
248 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  47.5 
 
 
248 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  47.5 
 
 
248 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  52.19 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  49.41 
 
 
253 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  49.41 
 
 
253 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  49.41 
 
 
253 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  50.9 
 
 
239 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  50.2 
 
 
243 aa  231  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  49.8 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  49.21 
 
 
253 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  50.45 
 
 
238 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  52.05 
 
 
252 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  49.34 
 
 
255 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  47.08 
 
 
247 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
248 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 
244 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 
244 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 
244 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  47.98 
 
 
252 aa  228  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 
248 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 
248 aa  228  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  49.8 
 
 
262 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 
248 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 
248 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  46.25 
 
 
249 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  50.42 
 
 
254 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  52.53 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
289 aa  225  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 
249 aa  225  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  50.92 
 
 
250 aa  224  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 
281 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  47.27 
 
 
254 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 
277 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  51.36 
 
 
301 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  51.36 
 
 
301 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  51.15 
 
 
253 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  47.53 
 
 
289 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  51.61 
 
 
276 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
279 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  50.24 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  48.4 
 
 
245 aa  222  6e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  51.15 
 
 
276 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
257 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  51.15 
 
 
276 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  50.66 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  50.23 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  49.1 
 
 
262 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  49.3 
 
 
299 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  49.35 
 
 
246 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  48.78 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>