More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2742 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
236 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  84.3 
 
 
239 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  84.75 
 
 
238 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  64.41 
 
 
248 aa  296  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  67.12 
 
 
243 aa  292  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 
242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  62.62 
 
 
241 aa  249  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 
248 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  52.99 
 
 
251 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  52.59 
 
 
254 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  53.57 
 
 
234 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  49.38 
 
 
251 aa  223  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  50.42 
 
 
251 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  53.12 
 
 
254 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  52.47 
 
 
255 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  52.84 
 
 
283 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  48.29 
 
 
266 aa  218  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  51.05 
 
 
254 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  47.9 
 
 
245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  48.2 
 
 
251 aa  214  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  52.44 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  52.7 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  52.47 
 
 
253 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  51.56 
 
 
255 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  48.51 
 
 
266 aa  207  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  48.05 
 
 
246 aa  205  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 
253 aa  204  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  44.68 
 
 
247 aa  204  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 
248 aa  204  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
248 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 
248 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 
248 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
248 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
248 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
248 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 
248 aa  202  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  44.86 
 
 
247 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  46.98 
 
 
262 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  50.73 
 
 
247 aa  202  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  46.26 
 
 
255 aa  201  9e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  47.9 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  47.9 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  44.86 
 
 
248 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
249 aa  198  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  46.38 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  45.12 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  43.04 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  47.91 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  45.12 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  47.89 
 
 
280 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  45.12 
 
 
260 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  47.6 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  48.36 
 
 
251 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  46.46 
 
 
264 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  47.42 
 
 
253 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  45.81 
 
 
250 aa  194  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
299 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  42.52 
 
 
253 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  47.74 
 
 
245 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  48.36 
 
 
253 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  47.74 
 
 
245 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  47.64 
 
 
265 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  43.7 
 
 
248 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  47.42 
 
 
276 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 
281 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  44.21 
 
 
257 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 
253 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 
245 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
289 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  44.58 
 
 
245 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  44.08 
 
 
289 aa  191  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 
276 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 
276 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  47.42 
 
 
277 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  42.79 
 
 
247 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  45.96 
 
 
262 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  46.73 
 
 
250 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  47.42 
 
 
279 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  43.26 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  45.33 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  44.54 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 
251 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  46.01 
 
 
253 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  46.73 
 
 
255 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  44.68 
 
 
278 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 
251 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
251 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
253 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  51.32 
 
 
264 aa  188  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
253 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  46.01 
 
 
253 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  46.26 
 
 
255 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
253 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  41.78 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  46.26 
 
 
250 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  45.91 
 
 
261 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  46.75 
 
 
262 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
251 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>