More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0481 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 260 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  57.52 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  61.4 
 
 		 252 aa  275  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  58.15 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  50.19 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  55.33 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  58.37 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  55.73 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  60.26 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  56 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  61.88 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  55.04 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  55.6 
 
 		 247 aa  255  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  58.26 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  60.38 
 
 		 222 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  58.96 
 
 		 222 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  53.25 
 
 		 231 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  50.99 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  50.42 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  53.3 
 
 		 244 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  53.3 
 
 		 244 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  53.3 
 
 		 244 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  51.98 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  56.05 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  55.11 
 
 		 223 aa  238  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  52.89 
 
 		 238 aa  238  9e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  52.34 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  58.85 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  50.64 
 
 		 245 aa  234  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  49.57 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  51.53 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  56.36 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  49.79 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  52.07 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  52.56 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  53.46 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  52.16 
 
 		 317 aa  228  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  49.36 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  50.46 
 
 		 299 aa  228  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  48.46 
 
 		 289 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  53.91 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  50.88 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  50.46 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  48.32 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  44.96 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  48.68 
 
 		 289 aa  224  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  51.9 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  52.34 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  51.87 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  53.74 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  50.95 
 
 		 254 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  45.78 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  46.59 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  50.96 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  51.67 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  51.43 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  51.87 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  51.38 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  51.52 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  48.71 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  51.35 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  48.93 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  51.15 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  48.51 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  45.78 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  50.7 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3565  flagellar biosynthesis protein FliP  48.22 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.809512  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  50.45 
 
 		 253 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  48.35 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  45.53 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  48.35 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  47.79 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  47.79 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  51.82 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  50.66 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  52.88 
 
 		 287 aa  218  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  50.45 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  50.45 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  50.45 
 
 		 276 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  48.4 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  48.35 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  47.77 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  48.47 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  50.22 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  51.44 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  52.56 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  47.11 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  46.88 
 
 		 274 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  52.07 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  48.68 
 
 		 246 aa  215  7e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  54.37 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  47.91 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  47.91 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  47.91 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  47.91 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>