More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1634 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1634  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 
337 aa  666    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.296967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  52.15 
 
 
252 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  52.89 
 
 
251 aa  235  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  53.23 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  53.59 
 
 
252 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  57.89 
 
 
222 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  55.83 
 
 
254 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  54.59 
 
 
213 aa  231  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  52 
 
 
251 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  51.63 
 
 
257 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  53.4 
 
 
283 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  54.72 
 
 
254 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  50.41 
 
 
254 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
251 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  50.48 
 
 
289 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  53.4 
 
 
248 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  53.59 
 
 
257 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
251 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  49.32 
 
 
253 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  51.92 
 
 
255 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  50.95 
 
 
280 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  53.17 
 
 
260 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
250 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  53.3 
 
 
255 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  49.1 
 
 
253 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  56.08 
 
 
246 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
255 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  53.4 
 
 
234 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  53.88 
 
 
248 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  48.15 
 
 
289 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  48.57 
 
 
253 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  50.7 
 
 
253 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
251 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  52.94 
 
 
256 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  48.42 
 
 
251 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  52.91 
 
 
251 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  49.1 
 
 
255 aa  225  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  58.42 
 
 
223 aa  225  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
248 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  51.18 
 
 
245 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  50.91 
 
 
301 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  50.91 
 
 
301 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
248 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  50.93 
 
 
274 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
248 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
248 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  48.34 
 
 
293 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
246 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  55.5 
 
 
222 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  50.71 
 
 
245 aa  222  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
245 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
245 aa  222  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
245 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
245 aa  222  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  52.22 
 
 
287 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
245 aa  222  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
245 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
255 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  51.46 
 
 
247 aa  222  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  50.97 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  50.24 
 
 
245 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
247 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
248 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
248 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
245 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  50.71 
 
 
253 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  50.46 
 
 
274 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  47.73 
 
 
252 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  50.46 
 
 
274 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  47.64 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  48.18 
 
 
250 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  50.47 
 
 
261 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  45.12 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  54.21 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 
261 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 
254 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  49.52 
 
 
253 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  53.97 
 
 
262 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
276 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  47.73 
 
 
255 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  47.39 
 
 
277 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  47.27 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49.52 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  51.13 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
281 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49.52 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  50.93 
 
 
258 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  51.92 
 
 
244 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  50.68 
 
 
278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  47.73 
 
 
248 aa  215  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>