More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1666 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
287 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  60 
 
 
293 aa  315  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0857  flagellar biosynthesis protein FliP  65.65 
 
 
318 aa  288  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  61.34 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  62.73 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  58.09 
 
 
276 aa  275  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31060  flagellar biosynthetic protein FliP  58.49 
 
 
283 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0743  flagellar biosynthesis protein FliP  62.77 
 
 
266 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  52.04 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  55.12 
 
 
222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0155  flagellar biosynthetic protein FliP  58.05 
 
 
229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  50.43 
 
 
248 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  52.73 
 
 
252 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  53.24 
 
 
255 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  52.78 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  55.9 
 
 
222 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  51.92 
 
 
250 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  51.85 
 
 
247 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  52.78 
 
 
251 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  52.53 
 
 
250 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  52.78 
 
 
251 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  52.68 
 
 
255 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  52.73 
 
 
223 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  53.85 
 
 
256 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
256 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  51.61 
 
 
250 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  52.68 
 
 
255 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  52.29 
 
 
261 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  53.62 
 
 
252 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  51.39 
 
 
252 aa  224  9e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  51.44 
 
 
255 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  55.61 
 
 
253 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  48.67 
 
 
257 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  55.07 
 
 
250 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  53.16 
 
 
254 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  51.08 
 
 
258 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
260 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  54.21 
 
 
221 aa  222  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  51.13 
 
 
281 aa  222  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  53.44 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  50.99 
 
 
247 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  52.81 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  50.99 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  50.91 
 
 
274 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  51.27 
 
 
262 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  47.08 
 
 
251 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1406  flagellar biosynthetic protein FliP  50.65 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1634  flagellar biosynthetic protein FliP  54.17 
 
 
337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.296967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  47.69 
 
 
245 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  49.01 
 
 
326 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  51.16 
 
 
213 aa  215  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  52.38 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  51.18 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  49.12 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  49.29 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  50.68 
 
 
265 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  46.75 
 
 
231 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  41.1 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  47.28 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  52.4 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 
248 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1753  flagellar biosynthesis protein FliP  47.48 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  51.54 
 
 
253 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  43.66 
 
 
289 aa  211  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  52.4 
 
 
251 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  48.18 
 
 
245 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1753  flagellar biosynthesis protein FliP  47.06 
 
 
249 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  48.18 
 
 
283 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  48.56 
 
 
254 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  43.32 
 
 
248 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  53.4 
 
 
276 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  53.4 
 
 
276 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  50.24 
 
 
289 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  51.1 
 
 
317 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  49.34 
 
 
264 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  47.78 
 
 
260 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  43.32 
 
 
248 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  51.52 
 
 
262 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  53.4 
 
 
276 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  48.65 
 
 
274 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  43.32 
 
 
248 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  48.65 
 
 
274 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  47.87 
 
 
252 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  46.05 
 
 
266 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  55.03 
 
 
262 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  45.29 
 
 
248 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  49.1 
 
 
249 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  47.09 
 
 
251 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  47.66 
 
 
248 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  47.66 
 
 
248 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  47.66 
 
 
248 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  47.66 
 
 
248 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  44.72 
 
 
253 aa  208  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  46.26 
 
 
255 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
247 aa  208  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  44.59 
 
 
251 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  48.18 
 
 
245 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
248 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  48.18 
 
 
245 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  48.18 
 
 
245 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>