More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0743 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0743  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
266 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  64.38 
 
 
287 aa  292  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  58.63 
 
 
293 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  59.34 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  60.81 
 
 
262 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  59.71 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31060  flagellar biosynthetic protein FliP  59.58 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0857  flagellar biosynthesis protein FliP  55.17 
 
 
318 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  52.36 
 
 
257 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  58.2 
 
 
254 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 
248 aa  230  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  47.98 
 
 
252 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  47.37 
 
 
253 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  51.14 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  51.14 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  52.91 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  53.74 
 
 
256 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  48.2 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
255 aa  216  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  50.24 
 
 
250 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  50.22 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  47.62 
 
 
247 aa  215  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  43.12 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  49.51 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  47.8 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  50.45 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  47.32 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  49.14 
 
 
246 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  49.04 
 
 
222 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  45.25 
 
 
252 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  47.95 
 
 
251 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  48.78 
 
 
257 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
301 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  47.85 
 
 
280 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  47.56 
 
 
255 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
301 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 
221 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  50.73 
 
 
261 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0155  flagellar biosynthetic protein FliP  52.36 
 
 
229 aa  209  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1634  flagellar biosynthetic protein FliP  52.33 
 
 
337 aa  208  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.296967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  50.48 
 
 
222 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  50.73 
 
 
213 aa  208  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  53.85 
 
 
317 aa  208  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 
289 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  46.34 
 
 
289 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  48.56 
 
 
229 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  46.96 
 
 
255 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  43.75 
 
 
231 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  52.51 
 
 
259 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  49.29 
 
 
299 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 
255 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  48 
 
 
251 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  47.5 
 
 
253 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  44.78 
 
 
248 aa  205  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  47.5 
 
 
253 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  47.5 
 
 
253 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  48.66 
 
 
255 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  47.51 
 
 
253 aa  204  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 
250 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  48.83 
 
 
252 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  47.5 
 
 
253 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  45.21 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  52.79 
 
 
251 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  49.28 
 
 
251 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  49.28 
 
 
251 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  49.54 
 
 
251 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  49.28 
 
 
251 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  44.98 
 
 
250 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  51.44 
 
 
254 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  48.66 
 
 
246 aa  202  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  45.77 
 
 
245 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  48.6 
 
 
260 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  47.56 
 
 
251 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 
248 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 
248 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 
248 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 
248 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  52.17 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  45.34 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  47.68 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  44.16 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  44.26 
 
 
262 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  48.03 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  47.6 
 
 
253 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  48.44 
 
 
251 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  47.16 
 
 
254 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  48.03 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  51.71 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  48.44 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  50.96 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  48.03 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  51.53 
 
 
254 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
249 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  49.31 
 
 
245 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  49.31 
 
 
245 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  49.31 
 
 
245 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  49.31 
 
 
245 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  46.09 
 
 
277 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>