More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0155 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0155  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 
229 aa  432  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  58.05 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  54.59 
 
 
293 aa  232  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  56.52 
 
 
276 aa  228  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  49.78 
 
 
252 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0857  flagellar biosynthesis protein FliP  56.83 
 
 
318 aa  223  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  51.58 
 
 
260 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  53.14 
 
 
262 aa  215  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  51.6 
 
 
255 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  52.78 
 
 
253 aa  215  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  52.78 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  52.78 
 
 
253 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1406  flagellar biosynthetic protein FliP  58.15 
 
 
272 aa  214  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  51.14 
 
 
255 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  52.88 
 
 
222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  48.62 
 
 
251 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  50.66 
 
 
256 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  48.17 
 
 
251 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  48.17 
 
 
255 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  50.47 
 
 
252 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  46.64 
 
 
257 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  49.33 
 
 
261 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  51.2 
 
 
277 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  48.17 
 
 
251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  48.03 
 
 
260 aa  208  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  49.34 
 
 
251 aa  208  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
261 aa  208  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  48.61 
 
 
299 aa  208  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  49.54 
 
 
250 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  45.23 
 
 
266 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  48.9 
 
 
251 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  49.54 
 
 
250 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  49.25 
 
 
247 aa  206  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  51.17 
 
 
221 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  48.15 
 
 
289 aa  205  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  53.03 
 
 
222 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  48.15 
 
 
289 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  50.71 
 
 
277 aa  204  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 
262 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  50.46 
 
 
255 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  47.93 
 
 
253 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  50.67 
 
 
223 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 
279 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1634  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 
337 aa  202  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.296967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 
255 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  49.29 
 
 
253 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  47.09 
 
 
257 aa  201  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49.29 
 
 
276 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49.29 
 
 
276 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  47.77 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  48.2 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  54.36 
 
 
283 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  47.77 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  47.77 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  52.11 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  48.23 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  47.77 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  49.29 
 
 
276 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  47.49 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  48.58 
 
 
258 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  46.43 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  46.88 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  47.64 
 
 
251 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 
249 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
281 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  47.37 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  47.17 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  49.51 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  49.05 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  43.36 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  46.92 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  48.84 
 
 
254 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  48.02 
 
 
254 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  48.82 
 
 
253 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  48.85 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  45.62 
 
 
248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  44.69 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  44.69 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  50.73 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  43.38 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  44.69 
 
 
244 aa  195  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  48.06 
 
 
213 aa  194  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  43.95 
 
 
280 aa  194  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  48.77 
 
 
265 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  48.86 
 
 
234 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  49.52 
 
 
251 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  47.32 
 
 
264 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  46.92 
 
 
250 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  46.92 
 
 
246 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>