More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2011 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 
276 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  69.55 
 
 
262 aa  309  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31060  flagellar biosynthetic protein FliP  69.79 
 
 
283 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  60.59 
 
 
293 aa  295  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  61.75 
 
 
287 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  57.32 
 
 
277 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0857  flagellar biosynthesis protein FliP  59.31 
 
 
318 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  49.34 
 
 
257 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  52.14 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0155  flagellar biosynthetic protein FliP  55.92 
 
 
229 aa  231  9e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  53.06 
 
 
222 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  52.97 
 
 
255 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  51.87 
 
 
260 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  51.6 
 
 
251 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 
255 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  51.52 
 
 
250 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 
255 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  52.53 
 
 
258 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  52.86 
 
 
251 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  52.86 
 
 
251 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  50.9 
 
 
256 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  51.38 
 
 
254 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  52.05 
 
 
250 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  53.33 
 
 
261 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  47.77 
 
 
250 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  51.14 
 
 
252 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  53.23 
 
 
326 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  48.28 
 
 
249 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  50.23 
 
 
254 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  52.55 
 
 
222 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  52.38 
 
 
245 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  52.38 
 
 
245 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  52.38 
 
 
245 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  52.38 
 
 
245 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  52.97 
 
 
246 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  52.68 
 
 
245 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  52.27 
 
 
223 aa  222  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 
256 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  44.65 
 
 
281 aa  222  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  48.8 
 
 
245 aa  221  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  49.33 
 
 
261 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  53.08 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  53.68 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  51.14 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  53 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  49.79 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  45.73 
 
 
247 aa  219  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 
247 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  49.52 
 
 
280 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  48.77 
 
 
251 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  43.38 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 
254 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  45.25 
 
 
252 aa  218  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
245 aa  217  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  51.83 
 
 
238 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  49.12 
 
 
251 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  47.73 
 
 
251 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
251 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 
257 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  48.44 
 
 
255 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  51.15 
 
 
274 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  52.61 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  46.96 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  51.71 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  49.53 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  50.46 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  51.71 
 
 
244 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  50.24 
 
 
244 aa  216  4e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  43.08 
 
 
260 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  50.24 
 
 
253 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  48.84 
 
 
251 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  48.84 
 
 
251 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  51.89 
 
 
289 aa  214  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  51.61 
 
 
274 aa  214  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  51.61 
 
 
274 aa  214  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  51.22 
 
 
244 aa  214  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  53.44 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  48.8 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  43.89 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 
253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  50.95 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  48.84 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  47.96 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0743  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  51.83 
 
 
221 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>