More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2282 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 		 326 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  52.09 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  52.09 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 		 247 aa  236  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  49.54 
 
 		 257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  55.79 
 
 		 253 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 		 257 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  45.57 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  52.63 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  49.1 
 
 		 223 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  51.2 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  54.21 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  48.15 
 
 		 252 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  52.63 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  54.19 
 
 		 258 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  52.15 
 
 		 276 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  52.15 
 
 		 276 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  51.17 
 
 		 253 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  46.86 
 
 		 277 aa  225  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  50.25 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  45.93 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  45.93 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  45.93 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  49.04 
 
 		 244 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  48.5 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  55.33 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  48.56 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  48.56 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  50.98 
 
 		 253 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  49.28 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  49.52 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  50.24 
 
 		 253 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  55.33 
 
 		 245 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  47.83 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  54.31 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  50.51 
 
 		 222 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  55.84 
 
 		 274 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 253 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  51.23 
 
 		 264 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  49.54 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  53.44 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  51.58 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  54.31 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  54.31 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  54.31 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  54.31 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  54.31 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  50.26 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  54.31 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0857  flagellar biosynthesis protein FliP  53.4 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  48.86 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  46.86 
 
 		 244 aa  218  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  48.43 
 
 		 221 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  48.31 
 
 		 255 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  45.93 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  49.07 
 
 		 247 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  54.82 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  48.23 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  54.82 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  49.75 
 
 		 265 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  51.71 
 
 		 262 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  47.79 
 
 		 248 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  47.79 
 
 		 248 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  47.79 
 
 		 248 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  47.79 
 
 		 248 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  49.06 
 
 		 252 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  44.8 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  49.51 
 
 		 250 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  47.49 
 
 		 249 aa  215  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  47.95 
 
 		 248 aa  215  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  48.78 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  51.21 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  49.5 
 
 		 229 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  55.26 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  49.75 
 
 		 278 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  46.85 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 249 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 		 253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 249 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 		 253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  45.91 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  47.95 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  49.78 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  45.91 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  50.24 
 
 		 255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  47.32 
 
 		 253 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>