More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0063 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 229 aa  448  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  49.5 
 
 		 326 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  54.31 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  51.98 
 
 		 261 aa  204  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  53.81 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  52.43 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  52.43 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  47.52 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  51.46 
 
 		 250 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  49.5 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49.75 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  48.28 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  50.97 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  50.97 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  49.75 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  49.75 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  48.78 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  51.46 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  50.25 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  50.97 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  47.51 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  51.46 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  46.04 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  51.46 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  47.03 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  48.68 
 
 		 254 aa  198  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 		 253 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 		 253 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 		 253 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  48.51 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  46.8 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  48.51 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  48.51 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  48.51 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  47.96 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  50.26 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  50.79 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  45.41 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  49.28 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  48.03 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  50.73 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  51.91 
 
 		 317 aa  195  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  47.29 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  45.19 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  49.26 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  48.78 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  50.25 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  49.51 
 
 		 279 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  51.32 
 
 		 249 aa  194  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  51.05 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  48.29 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  49.03 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  47.66 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  49.74 
 
 		 254 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  46.43 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  49.5 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  51.53 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  52.46 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  49.76 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  49.01 
 
 		 250 aa  191  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  45.58 
 
 		 266 aa  191  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  46.63 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  48.29 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  45.81 
 
 		 277 aa  191  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  48.29 
 
 		 280 aa  191  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  47.03 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  46.26 
 
 		 222 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  47.78 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  50.79 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  47.12 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  45.32 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  49.75 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  51.56 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0089  flagellar biosynthesis protein FliP  48.36 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  48.02 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  44.34 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  44.34 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  49.01 
 
 		 289 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  45.81 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  49.49 
 
 		 245 aa  187  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  49.22 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>