More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2000 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  100 
 
 
216 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  100 
 
 
216 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  100 
 
 
216 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  72.94 
 
 
218 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  72.94 
 
 
218 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  73.15 
 
 
216 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  73.61 
 
 
216 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  73.61 
 
 
216 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  73.61 
 
 
216 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  73.61 
 
 
216 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  72.69 
 
 
216 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  73.61 
 
 
216 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  73.15 
 
 
216 aa  324  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  68.84 
 
 
214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  64.68 
 
 
217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  66.16 
 
 
220 aa  272  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  55.24 
 
 
224 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  54.76 
 
 
224 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  54.76 
 
 
224 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  54.76 
 
 
224 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  54.29 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  54.29 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  46.05 
 
 
216 aa  216  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  45.58 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  47.91 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  46.05 
 
 
217 aa  205  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  45.77 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  44.78 
 
 
216 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  39.61 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  39.13 
 
 
216 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  39.19 
 
 
311 aa  177  8e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  38.97 
 
 
220 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  38.35 
 
 
236 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  39.2 
 
 
216 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  39.2 
 
 
216 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  40.39 
 
 
217 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  43.22 
 
 
211 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  38.79 
 
 
257 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  41 
 
 
217 aa  158  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  45.26 
 
 
223 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  43.07 
 
 
216 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  40.78 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  36.15 
 
 
221 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  37.38 
 
 
215 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  36.53 
 
 
252 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  37.38 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  37.38 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  36.15 
 
 
221 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  37.38 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  37.38 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  35.68 
 
 
221 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  39.7 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  36.15 
 
 
221 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  39.32 
 
 
253 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  40.98 
 
 
255 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  38.83 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  38.83 
 
 
253 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  40.5 
 
 
217 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  38.83 
 
 
283 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  35.45 
 
 
230 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  40.5 
 
 
217 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  37.8 
 
 
253 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  38.28 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  38.28 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  38.28 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  38.28 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  38.5 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  38.28 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  35.27 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  35.75 
 
 
244 aa  146  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  38.83 
 
 
251 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  39.71 
 
 
254 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  38.73 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  37.32 
 
 
265 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  39.07 
 
 
260 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  37 
 
 
221 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  37.32 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  37.32 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  37.32 
 
 
245 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  34.78 
 
 
244 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  37.86 
 
 
287 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  37.32 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  34.6 
 
 
250 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  37.32 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0703  type III secretion system protein  45.79 
 
 
225 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00859025  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  37.32 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  35.47 
 
 
262 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  37.32 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  37.31 
 
 
231 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  34.3 
 
 
244 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0739  type III secretion system protein  44.85 
 
 
225 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.177548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0738  type III secretion system protein  44.85 
 
 
225 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  33.33 
 
 
251 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  38.16 
 
 
251 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>