More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2212 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  82.49 
 
 		 217 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  70.51 
 
 		 217 aa  294  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  72.04 
 
 		 217 aa  291  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  70 
 
 		 200 aa  277  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  45.92 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  46.6 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  45.24 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  45.24 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  48.76 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  48.76 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  48.76 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  42.99 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  42.38 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  42.38 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  40.74 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  41.78 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  41.4 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  41.4 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  41.4 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  41.4 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  41.4 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  40.5 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  40.5 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  40.5 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  38.97 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  38.97 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  38.97 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  39.44 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  42.5 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  40.1 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  38.21 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  38.86 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  38.86 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  38.86 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  38.86 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  38.86 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  38.86 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  39.07 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  40.39 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  39.9 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  43.22 
 
 		 287 aa  158  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  39 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  41.71 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  38.05 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  42.31 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  37.56 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  42.65 
 
 		 326 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  43.14 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  41.35 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  42.38 
 
 		 293 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  41.51 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  37.39 
 
 		 311 aa  151  8e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  37.86 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  43.08 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  40.85 
 
 		 252 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0626  flagellar biosynthesis protein FliP  45.36 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  37.86 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0706  flagellar biosynthesis protein FliP  44.85 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 277 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0239  flagellar biosynthesis protein FliP  44.85 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.197588  normal  0.0281676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  43.96 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  43.22 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 279 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  37.93 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  40.19 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  42.72 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  41.97 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  40.58 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  41.79 
 
 		 299 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  40.7 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  40.28 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  41.45 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  40.28 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  40.19 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  40.28 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  40.28 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  42 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 		 276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  39.81 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 		 276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3593  flagellar biosynthesis protein FliP  42.31 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  40.2 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  43.07 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  40.28 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  42.71 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  42.03 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  40.2 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  40 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  42.44 
 
 		 251 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 274 aa  144  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  41.83 
 
 		 265 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  42.21 
 
 		 253 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  39.71 
 
 		 251 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  40.1 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  40.69 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  42.21 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>