More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03406 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  72.35 
 
 		 217 aa  320  9.000000000000001e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  68.84 
 
 		 216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  68.84 
 
 		 216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  68.84 
 
 		 216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  65.28 
 
 		 218 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  65.28 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  62.15 
 
 		 216 aa  278  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  64.65 
 
 		 220 aa  274  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  60.56 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  60.09 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  60.09 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  60.09 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  60.09 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  60.09 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  60.09 
 
 		 216 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  56.68 
 
 		 224 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  56.68 
 
 		 224 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  56.22 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  56.22 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  56.22 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  55.76 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  51.87 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  50.93 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  50.93 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  52.48 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  50 
 
 		 217 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  49.75 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  44.93 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  44.93 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  44.93 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  40.09 
 
 		 311 aa  176  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  41.28 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  41.28 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  46.23 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  43.13 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  41.94 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  41.94 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  41.94 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  41.94 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  41.94 
 
 		 215 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  41.59 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  46.81 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  38.79 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  38.32 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  39.53 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  40.19 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  41.59 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  38.79 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  42.92 
 
 		 276 aa  158  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  40.8 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  42.03 
 
 		 287 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  43.22 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  40.78 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0089  flagellar biosynthesis protein FliP  44.81 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  44.22 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  41.23 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  40.29 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  39.42 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  40.29 
 
 		 253 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 244 aa  150  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  39.52 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  42.31 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  41.35 
 
 		 265 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  39.62 
 
 		 244 aa  149  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  39.02 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  40.2 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  40.2 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  42.93 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  40.76 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  39.45 
 
 		 250 aa  148  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  42.58 
 
 		 251 aa  148  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 		 253 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  39.7 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 		 253 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  42.51 
 
 		 277 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 262 aa  147  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  41.83 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  42.29 
 
 		 253 aa  147  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  41.35 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  41.83 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  41.06 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 		 276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  38.25 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 		 264 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 		 276 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 		 250 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 		 276 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  39.52 
 
 		 244 aa  145  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  39.32 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  40.29 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  38.27 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  38.24 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  39.52 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  40.29 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  38.1 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  38.94 
 
 		 279 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  40.48 
 
 		 253 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>