More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5644 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  99.54 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  72.94 
 
 		 216 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  72.94 
 
 		 216 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  72.94 
 
 		 216 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  73.73 
 
 		 216 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  73.27 
 
 		 216 aa  324  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  73.27 
 
 		 216 aa  324  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  73.27 
 
 		 216 aa  324  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  73.27 
 
 		 216 aa  324  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  73.27 
 
 		 216 aa  324  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  72.81 
 
 		 216 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  71.56 
 
 		 216 aa  321  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  66.2 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  65.28 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  65.66 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  52.38 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  51.9 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  51.9 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  51.9 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  51.43 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  51.43 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  45.62 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  45.16 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  46.79 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  45.7 
 
 		 217 aa  207  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  45.05 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  43.56 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  38.43 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  38.43 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  36.32 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  37.78 
 
 		 311 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  36.32 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  36.32 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  39.61 
 
 		 220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  36.32 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  36.32 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  37.81 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  37.81 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  37.81 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  38.86 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  45.26 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  41.79 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  37.96 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  34.74 
 
 		 252 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  39.81 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  38.84 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  40.87 
 
 		 255 aa  147  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  39.61 
 
 		 283 aa  147  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  36.36 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  41.18 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  39.61 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  40.89 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  39.61 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  35.75 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  37.2 
 
 		 287 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  38.83 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  39.13 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  38.61 
 
 		 266 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  38.39 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  36.11 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  35.38 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  36.11 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  36.11 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  36.11 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  36.11 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  36.11 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  35.45 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  38.94 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  33.81 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  33.81 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  34.91 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  33.81 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  33.81 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  33.81 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  35.32 
 
 		 252 aa  141  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  39.13 
 
 		 251 aa  141  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  34.83 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  35.38 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  35.47 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  40.39 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  34.3 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  35.27 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  37.02 
 
 		 276 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  35.05 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  34.62 
 
 		 245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  35.38 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  37.68 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  35.03 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  36.74 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  34.13 
 
 		 261 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  39.44 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  34.4 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  35.96 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  37.14 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  33.18 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  34.12 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  34.12 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  36.06 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  35.78 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>