More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1885 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  100 
 
 
217 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  82.49 
 
 
217 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  70.51 
 
 
217 aa  294  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  71.09 
 
 
217 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  69 
 
 
200 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  46.77 
 
 
216 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  46.77 
 
 
216 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  46.77 
 
 
236 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  44.39 
 
 
217 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  43.33 
 
 
216 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  43.46 
 
 
217 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  42.86 
 
 
216 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  43.07 
 
 
216 aa  181  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  43.07 
 
 
216 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  40.83 
 
 
217 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  41.12 
 
 
216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  41.18 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  41.18 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  41.18 
 
 
215 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  41.18 
 
 
215 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  41.18 
 
 
215 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  40.57 
 
 
216 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  38.14 
 
 
220 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  40.19 
 
 
224 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  41.71 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  39.72 
 
 
224 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  39.72 
 
 
224 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  39.72 
 
 
224 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  39.53 
 
 
224 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  39.53 
 
 
224 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  40.49 
 
 
221 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  39.91 
 
 
218 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  38.12 
 
 
217 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  39.44 
 
 
218 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  40 
 
 
221 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  42.72 
 
 
254 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  41.79 
 
 
214 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  43.78 
 
 
287 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  36.07 
 
 
230 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  38 
 
 
216 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  38 
 
 
216 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  38 
 
 
216 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  36.28 
 
 
226 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  40.49 
 
 
221 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  42.25 
 
 
258 aa  154  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  39.51 
 
 
221 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  42.38 
 
 
274 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 
274 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 
274 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0626  flagellar biosynthesis protein FliP  44.1 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0706  flagellar biosynthesis protein FliP  43.59 
 
 
256 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0239  flagellar biosynthesis protein FliP  43.59 
 
 
256 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.197588  normal  0.0281676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  42.36 
 
 
293 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  41.46 
 
 
326 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  36.96 
 
 
311 aa  150  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  41.67 
 
 
248 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  43.3 
 
 
250 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  37.44 
 
 
216 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  40.98 
 
 
213 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  36 
 
 
216 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3095  surface presentation of antigens protein SpaP  39.81 
 
 
224 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3200  surface presentation of antigens protein SpaP  39.81 
 
 
224 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3043  surface presentation of antigens protein SpaP  39.81 
 
 
224 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3080  surface presentation of antigens protein SpaP  39.81 
 
 
224 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.833245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3012  surface presentation of antigens protein SpaP  39.81 
 
 
224 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  42.78 
 
 
250 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  43.06 
 
 
264 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 
245 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  43.22 
 
 
239 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  40.47 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1881  flagellar biosynthesis protein FliP  42.33 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  38.01 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  40.67 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  41.26 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  42 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  43.22 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  40.67 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  41.79 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  41.23 
 
 
265 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  40.8 
 
 
222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2585  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 
245 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 
276 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 
276 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 
276 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  39.9 
 
 
253 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  39.52 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  39.9 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  34.67 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>