More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0851 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  100 
 
 
311 aa  623  1e-177  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  39.19 
 
 
216 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  39.19 
 
 
216 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  39.19 
 
 
216 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  40.09 
 
 
214 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  43.3 
 
 
216 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  43.3 
 
 
216 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  40.28 
 
 
216 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  40.76 
 
 
216 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  37.73 
 
 
216 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  38.43 
 
 
224 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  38.43 
 
 
224 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  37.78 
 
 
218 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  40.65 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  39.44 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  39.44 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  37.78 
 
 
218 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  39.44 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  38.89 
 
 
224 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  40.45 
 
 
216 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  41.18 
 
 
217 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  40.91 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  40 
 
 
220 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  37.39 
 
 
216 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  37.39 
 
 
216 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  37.39 
 
 
216 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  37.39 
 
 
216 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  37.56 
 
 
216 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  37.39 
 
 
216 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  37.39 
 
 
216 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  39.91 
 
 
236 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  39.91 
 
 
216 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  39.91 
 
 
216 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  38.12 
 
 
215 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  38.12 
 
 
215 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  38.12 
 
 
215 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  38.12 
 
 
215 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  38.12 
 
 
215 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  39.91 
 
 
252 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  42.64 
 
 
217 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  38.93 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  39.59 
 
 
248 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  40.83 
 
 
244 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  40.37 
 
 
244 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  40.37 
 
 
244 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  41.4 
 
 
244 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  39.07 
 
 
255 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  38.32 
 
 
254 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  37.55 
 
 
248 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  37.45 
 
 
252 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0626  flagellar biosynthesis protein FliP  39.51 
 
 
256 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  38.32 
 
 
250 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  38.33 
 
 
252 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0239  flagellar biosynthesis protein FliP  39.02 
 
 
256 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.197588  normal  0.0281676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  37.77 
 
 
248 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0706  flagellar biosynthesis protein FliP  39.02 
 
 
256 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  38.99 
 
 
244 aa  149  6e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  38.74 
 
 
265 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  41.83 
 
 
217 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  38.32 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  38.72 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  37.61 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  39.19 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  38.53 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  37.18 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  40.09 
 
 
278 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  38.2 
 
 
250 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  40.95 
 
 
299 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  38.7 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  40.38 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  35 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  38.3 
 
 
249 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  34.8 
 
 
251 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  38.26 
 
 
253 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  38.71 
 
 
252 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  38.32 
 
 
262 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0083  flagellar biosynthesis protein FliP  44.71 
 
 
242 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2760  flagellar biosynthesis protein FliP  37.67 
 
 
271 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  36.6 
 
 
253 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 
274 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3481  flagellar biosynthesis protein FliP  43.63 
 
 
244 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  36.75 
 
 
253 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  36.89 
 
 
246 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  38.99 
 
 
251 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  38.76 
 
 
245 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  38.26 
 
 
276 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  38.26 
 
 
276 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3664  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 
243 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 
274 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  36.6 
 
 
253 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  39.32 
 
 
238 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  37.96 
 
 
261 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  39.17 
 
 
255 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  36.6 
 
 
253 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  39.57 
 
 
249 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  39.57 
 
 
249 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  38.64 
 
 
248 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  38.71 
 
 
255 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  37.3 
 
 
253 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>