More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3814 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  100 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  100 
 
 		 236 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  100 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  59.91 
 
 		 215 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  59.91 
 
 		 215 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  59.91 
 
 		 215 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  59.53 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  59.91 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  59.45 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  59.53 
 
 		 216 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  55.56 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  55.61 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  55.56 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  56.25 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  52.31 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  50.96 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  51.69 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  46.95 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  46.95 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  46.95 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  46.95 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  46.48 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  46.48 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  44.93 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  41.15 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  45.23 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  48.02 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  48 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  49.76 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  37.21 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  47.25 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  42.71 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  39.35 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  48.76 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  46.76 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  38.89 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  46.92 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  43.6 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  46.77 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  45.5 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  39.35 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  43.12 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  43.12 
 
 		 253 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  43.12 
 
 		 253 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  46.3 
 
 		 254 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  39.2 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  39.2 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  39.2 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  39.35 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3200  surface presentation of antigens protein SpaP  43.06 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3012  surface presentation of antigens protein SpaP  43.06 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  44.04 
 
 		 251 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3095  surface presentation of antigens protein SpaP  43.06 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3080  surface presentation of antigens protein SpaP  43.06 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.833245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3043  surface presentation of antigens protein SpaP  43.06 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  44.5 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  44.39 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  46.3 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  42.18 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  39.55 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  39.55 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  39.55 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  42.72 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  39.55 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  37.81 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  39.55 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  39.55 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  43.19 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  42.51 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  42.01 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  37.9 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  43.6 
 
 		 289 aa  161  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  37.31 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  43.58 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  42.18 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  43.72 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  41.98 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  41.71 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  40.95 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  41.98 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  38.84 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 		 251 aa  158  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  42.18 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  42.33 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  44.1 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  39.91 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  41.71 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  42.58 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  41.26 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  40.78 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  41.71 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  40.78 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  40.78 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  40.78 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  40.78 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  45.75 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  40.78 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  43.33 
 
 		 279 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  41.86 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>