More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0846 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  98.64 
 
 		 221 aa  424  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  98.19 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  97.29 
 
 		 221 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3080  surface presentation of antigens protein SpaP  68.61 
 
 		 224 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.833245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3012  surface presentation of antigens protein SpaP  68.61 
 
 		 224 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3095  surface presentation of antigens protein SpaP  68.61 
 
 		 224 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3043  surface presentation of antigens protein SpaP  68.61 
 
 		 224 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3200  surface presentation of antigens protein SpaP  68.61 
 
 		 224 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  57.21 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  58.99 
 
 		 216 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  42.52 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  46.73 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  42.79 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  45.33 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  41.63 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  39.35 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  39.35 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  39.35 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  43.41 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  39.53 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  37.79 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  37.33 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  37.33 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  41.31 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  37.33 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  37.33 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  37.33 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  36.62 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  41.26 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  41.26 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  41.26 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  41.26 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  41.26 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 216 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 216 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  39.9 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 216 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  37.96 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  37.5 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  38.32 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  38.14 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  36.54 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  36.1 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  37.5 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  35.61 
 
 		 255 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  35.61 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  35.61 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  35.38 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  38.97 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  37.02 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  36.59 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  36.54 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  36.59 
 
 		 250 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  36.55 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  36.84 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  34.74 
 
 		 252 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  36.59 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  35.35 
 
 		 244 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  36.82 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4067  flagellar biosynthetic protein FliP  34.82 
 
 		 339 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  34.58 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  36.41 
 
 		 311 aa  136  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  37.56 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  36.06 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  36.06 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  37.09 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  36.06 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  36.06 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  36.06 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  36.54 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  35.98 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  37.56 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  39.51 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1168  flagellar biosynthetic protein FliP  36.73 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.655036  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  35.89 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  36.74 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  35.85 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  36.62 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  35.85 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  36.74 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  36.87 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  36.45 
 
 		 251 aa  134  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  33.8 
 
 		 253 aa  134  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  35.18 
 
 		 220 aa  134  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  36.74 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  35.98 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  35.61 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  31.6 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  36.74 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  37.62 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  36.74 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>