More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4067 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4067  flagellar biosynthetic protein FliP  100 
 
 
339 aa  676    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  49.17 
 
 
250 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  46.15 
 
 
247 aa  215  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  45.75 
 
 
247 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  49.34 
 
 
255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  44.98 
 
 
251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  46.31 
 
 
248 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  44.94 
 
 
252 aa  208  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  46.49 
 
 
222 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  44.67 
 
 
245 aa  205  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  44.4 
 
 
256 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  44.16 
 
 
266 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  45.06 
 
 
222 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  43.37 
 
 
247 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  43.57 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  43.36 
 
 
260 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  44.31 
 
 
248 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  45.34 
 
 
243 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  43.5 
 
 
252 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  43.98 
 
 
244 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  43.98 
 
 
244 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  47.62 
 
 
246 aa  192  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  43.57 
 
 
244 aa  192  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
254 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  42.74 
 
 
244 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  41.73 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  47.83 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  46.64 
 
 
251 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  46.15 
 
 
254 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  42.35 
 
 
244 aa  188  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  45.64 
 
 
254 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  45.38 
 
 
223 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  46.64 
 
 
251 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  43.6 
 
 
238 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  45.23 
 
 
255 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  45.42 
 
 
277 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  40.35 
 
 
281 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  46.64 
 
 
251 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  45.23 
 
 
254 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  45.53 
 
 
221 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  42.54 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  46.19 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  45.29 
 
 
234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  43.4 
 
 
253 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  45.66 
 
 
262 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  45.25 
 
 
231 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  47.37 
 
 
256 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  43.6 
 
 
251 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  41.23 
 
 
250 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  40.39 
 
 
266 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  43.65 
 
 
281 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  44.9 
 
 
246 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 
250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  45.15 
 
 
264 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  44.2 
 
 
253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  38.76 
 
 
248 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  38.76 
 
 
248 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  42.98 
 
 
253 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.2 
 
 
253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  38.76 
 
 
248 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  44.2 
 
 
253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  38.76 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  44.2 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 
253 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 
253 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  42.98 
 
 
253 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  44.05 
 
 
278 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  44 
 
 
287 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 
253 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  48.18 
 
 
251 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  40.66 
 
 
280 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  38.55 
 
 
248 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  39.75 
 
 
248 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  42.55 
 
 
255 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  39.75 
 
 
248 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  39.75 
 
 
248 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  39.75 
 
 
248 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  40 
 
 
293 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  39.51 
 
 
252 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  47.73 
 
 
251 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  39.92 
 
 
255 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 
276 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  44.16 
 
 
253 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  46.02 
 
 
301 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  43.44 
 
 
261 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 
276 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  41.46 
 
 
262 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  46.02 
 
 
301 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  44.64 
 
 
276 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  44.71 
 
 
262 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  46.36 
 
 
254 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  42.04 
 
 
249 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  43.5 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  46.46 
 
 
261 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  40.36 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0655  flagellar biosynthesis protein FliP  41.23 
 
 
252 aa  175  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  38.31 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  43.95 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  42.41 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>