More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0655 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0655  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
252 aa  489  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  47.54 
 
 
248 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  53.02 
 
 
252 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  48.29 
 
 
252 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  47.73 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  45.31 
 
 
251 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  47.27 
 
 
255 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  48.64 
 
 
250 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  49.28 
 
 
245 aa  214  8e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  48.56 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  45.5 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  42.35 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  42.35 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  42.35 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  42.35 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  52.36 
 
 
221 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  49.51 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  49.51 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  45.22 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  49.27 
 
 
244 aa  210  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  42.8 
 
 
247 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  47.14 
 
 
289 aa  210  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  43.93 
 
 
280 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  52.06 
 
 
238 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  49.27 
 
 
244 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
244 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
289 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  43.7 
 
 
255 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  44.14 
 
 
250 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  45.33 
 
 
251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  43.22 
 
 
250 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 
261 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  44.05 
 
 
249 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  42.49 
 
 
289 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  42.4 
 
 
249 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  44.05 
 
 
248 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1634  flagellar biosynthetic protein FliP  50.51 
 
 
337 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.296967  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  47.32 
 
 
244 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  42.11 
 
 
248 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  42 
 
 
248 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  42.51 
 
 
248 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  48.36 
 
 
260 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  42.11 
 
 
248 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  51.03 
 
 
254 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  45.53 
 
 
260 aa  205  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  48.29 
 
 
299 aa  205  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  51.92 
 
 
223 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
251 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  40.32 
 
 
245 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  41.67 
 
 
248 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  47.64 
 
 
266 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  50.48 
 
 
254 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  42.8 
 
 
253 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  41.13 
 
 
293 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  43.64 
 
 
247 aa  202  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
222 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  43.93 
 
 
251 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  46.19 
 
 
256 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  49.3 
 
 
251 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  47.35 
 
 
234 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  50.26 
 
 
243 aa  202  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
255 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
255 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  46.26 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  41.56 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  47.92 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  41.56 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  41.56 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  41.56 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  43.75 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  48.84 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  45 
 
 
253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  45 
 
 
253 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  44 
 
 
253 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1394  flagellar biosynthesis protein FliP  51.74 
 
 
249 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  45.79 
 
 
283 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  45 
 
 
253 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  48.33 
 
 
222 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3565  flagellar biosynthesis protein FliP  43.24 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.809512  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  41.98 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  41.15 
 
 
265 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  44.55 
 
 
255 aa  198  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  46.64 
 
 
281 aa  198  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  44.2 
 
 
276 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  44.86 
 
 
276 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  44.2 
 
 
276 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  45.15 
 
 
326 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  41.59 
 
 
245 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  39.34 
 
 
245 aa  197  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  39.34 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  39.34 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  42.67 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  39.34 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  41.85 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  39.34 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  46.86 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>