More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0449 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  100 
 
 
220 aa  434  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  69.31 
 
 
217 aa  293  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  62.91 
 
 
214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  63.38 
 
 
216 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  63.38 
 
 
216 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  63.38 
 
 
216 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  61.97 
 
 
218 aa  276  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  61.97 
 
 
218 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  60 
 
 
216 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  62.26 
 
 
216 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  62.26 
 
 
216 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  62.26 
 
 
216 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  62.26 
 
 
216 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  62.26 
 
 
216 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  62.26 
 
 
216 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  61.79 
 
 
216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  53.02 
 
 
224 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  53.02 
 
 
224 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  53.02 
 
 
224 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  53.49 
 
 
224 aa  237  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  52.56 
 
 
224 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  52.56 
 
 
224 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  49.53 
 
 
216 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  49.53 
 
 
216 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  47.47 
 
 
216 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  48.58 
 
 
217 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  45.16 
 
 
216 aa  204  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  49.25 
 
 
217 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  39.62 
 
 
216 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  38.68 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  43.2 
 
 
216 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  43.2 
 
 
236 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  43.2 
 
 
216 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  39.81 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  39.15 
 
 
215 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  39.15 
 
 
215 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  39.15 
 
 
215 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  39.15 
 
 
215 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  39.15 
 
 
215 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  41.2 
 
 
217 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  39.09 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  40.74 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  41.29 
 
 
200 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  39.9 
 
 
220 aa  158  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  39.91 
 
 
211 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  38.14 
 
 
217 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  40.1 
 
 
215 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  37.67 
 
 
217 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  39.44 
 
 
293 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  36.7 
 
 
257 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  43.94 
 
 
223 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  40.1 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  35.68 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  39.13 
 
 
253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  39.7 
 
 
254 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  35.29 
 
 
287 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  39.63 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 
236 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  34.58 
 
 
221 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  39.71 
 
 
253 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  34.11 
 
 
221 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  39.71 
 
 
253 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  33.5 
 
 
222 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  39.71 
 
 
253 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  36.2 
 
 
256 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  38.31 
 
 
265 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  34.34 
 
 
221 aa  141  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 
238 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0703  type III secretion system protein  44.79 
 
 
225 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00859025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  38.86 
 
 
289 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0739  type III secretion system protein  44.79 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.177548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0738  type III secretion system protein  44.79 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  38.39 
 
 
299 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  34.58 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 
239 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  33.33 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  36.7 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  35.78 
 
 
250 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  38.86 
 
 
289 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  38.73 
 
 
283 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  34.58 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  35.32 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  38.54 
 
 
264 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  36.45 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  33.81 
 
 
244 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  36.92 
 
 
276 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  38.73 
 
 
251 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  37.09 
 
 
276 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  37.09 
 
 
276 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  37.09 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  36.99 
 
 
223 aa  138  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  38.86 
 
 
317 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  32.42 
 
 
213 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  37.25 
 
 
250 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1406  flagellar biosynthetic protein FliP  38.42 
 
 
272 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0089  flagellar biosynthesis protein FliP  39.71 
 
 
242 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  33.03 
 
 
244 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  33.03 
 
 
244 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  37.09 
 
 
253 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  34.91 
 
 
256 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>