More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0676 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  99.54 
 
 
216 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  97.69 
 
 
216 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  73.61 
 
 
216 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  73.61 
 
 
216 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  73.61 
 
 
216 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  73.27 
 
 
218 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  73.27 
 
 
218 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  70.83 
 
 
216 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  60.09 
 
 
214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  62.62 
 
 
217 aa  271  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  65.48 
 
 
220 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  54.07 
 
 
224 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  53.11 
 
 
224 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  53.11 
 
 
224 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  53.11 
 
 
224 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  52.63 
 
 
224 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  52.63 
 
 
224 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  45.58 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  45.58 
 
 
216 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  46.05 
 
 
217 aa  214  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  46.05 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  44.28 
 
 
216 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  44.06 
 
 
216 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  36.71 
 
 
216 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  36.71 
 
 
216 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  38.79 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  40.78 
 
 
236 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  40.78 
 
 
216 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  40.78 
 
 
216 aa  168  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  37.56 
 
 
311 aa  167  9e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  38.65 
 
 
215 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  38.65 
 
 
215 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  38.65 
 
 
215 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  38.65 
 
 
215 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  38.65 
 
 
215 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 
257 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  35.96 
 
 
217 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  40.59 
 
 
211 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  39.59 
 
 
221 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  38.73 
 
 
251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  37.38 
 
 
293 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  32.72 
 
 
252 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  37.69 
 
 
200 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  36.68 
 
 
217 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  36.89 
 
 
250 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  35.85 
 
 
287 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  39.81 
 
 
277 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  40.2 
 
 
255 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  37.96 
 
 
251 aa  148  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  35.15 
 
 
222 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  36.76 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  36.89 
 
 
255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  37.19 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  38.61 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  38.61 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  37.25 
 
 
256 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  36.06 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  38.28 
 
 
260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  38.42 
 
 
253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  38.61 
 
 
283 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  36.84 
 
 
248 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  38.12 
 
 
215 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  38.57 
 
 
276 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  36.06 
 
 
221 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  35.1 
 
 
261 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  35.58 
 
 
221 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  33.97 
 
 
244 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  38.5 
 
 
251 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  36.55 
 
 
254 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  33.97 
 
 
244 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  33.49 
 
 
244 aa  142  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  36.54 
 
 
231 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0089  flagellar biosynthesis protein FliP  41.58 
 
 
242 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  33.18 
 
 
244 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  33.33 
 
 
226 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  33.33 
 
 
226 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  33.33 
 
 
226 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  34.76 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  36.89 
 
 
247 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  33.33 
 
 
226 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  33.33 
 
 
226 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  36.89 
 
 
247 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  36.06 
 
 
221 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  33.33 
 
 
226 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  34.76 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  36.23 
 
 
253 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  33.95 
 
 
257 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  37.07 
 
 
253 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  37.8 
 
 
245 aa  141  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  37.75 
 
 
253 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  40.21 
 
 
317 aa  141  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  32.9 
 
 
230 aa  141  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  37.75 
 
 
276 aa  141  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  39.69 
 
 
250 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  39.79 
 
 
223 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>