More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1395 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  93 
 
 		 217 aa  357  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  81.5 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  70 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  69 
 
 		 217 aa  270  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  46.23 
 
 		 216 aa  194  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  46.07 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  45.73 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  44.39 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  48.02 
 
 		 216 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  48.02 
 
 		 216 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  47 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  41.62 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  43.63 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  41.21 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  41.21 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  42.13 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  43.63 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  43.07 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  40.39 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  40.39 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  40.39 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  40.39 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  40.39 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  42.86 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  42.86 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  43.35 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  42.86 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  43.22 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  39.7 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  39.7 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  39.7 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  42.36 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  42.36 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  40.2 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  41.18 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  41.18 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  40.57 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  37.69 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  37.69 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  37.69 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  37.69 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  37.69 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  36.32 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  37.69 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  37.19 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  36.71 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  36.71 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  36.71 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  37.19 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  36.71 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  36.71 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  36.71 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  41.29 
 
 		 293 aa  151  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  40.5 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  36.32 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  41.21 
 
 		 326 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  36.82 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  41.71 
 
 		 287 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  42.5 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  42 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  40.89 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  40.98 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  43.28 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  39.6 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  37.69 
 
 		 260 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  38.19 
 
 		 253 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  37.69 
 
 		 260 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  40.7 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  44.15 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  40.7 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  40.7 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  40.59 
 
 		 253 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  40.59 
 
 		 276 aa  141  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  36.95 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  37.69 
 
 		 256 aa  141  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0738  type III secretion system protein  45.74 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0739  type III secretion system protein  45.74 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.177548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  40.59 
 
 		 276 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  40.59 
 
 		 276 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  38.61 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  40.2 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  39.32 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  39.32 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  43.22 
 
 		 238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  39.9 
 
 		 256 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  39.2 
 
 		 260 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  39.9 
 
 		 265 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  40.5 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  41.21 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  39.32 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  39.32 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0703  type III secretion system protein  45.21 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00859025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  41.5 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  39.2 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  38.46 
 
 		 255 aa  138  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  39.2 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  37.37 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>