More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2079 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  92.61 
 
 		 230 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  60.36 
 
 		 221 aa  275  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 221 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  59.46 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  58.37 
 
 		 216 aa  261  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3043  surface presentation of antigens protein SpaP  59.19 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3012  surface presentation of antigens protein SpaP  59.19 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3095  surface presentation of antigens protein SpaP  59.19 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3200  surface presentation of antigens protein SpaP  59.19 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3080  surface presentation of antigens protein SpaP  59.19 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.833245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  41.74 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  42.66 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  41.67 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  40.83 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  42.99 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  42.53 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  42.53 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  42.53 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  42.53 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  42.53 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  39.52 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  39.55 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  39.55 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  39.55 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  40.85 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  36.74 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  36.74 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  36.74 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  38.67 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  37.9 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  36.87 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  36.87 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  35.43 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  38.86 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  35.43 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  35.43 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  35.43 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  35.43 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  37.98 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  36.99 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  34.88 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  37.56 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  36.32 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  38.81 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4067  flagellar biosynthetic protein FliP  36.24 
 
 		 339 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  39.07 
 
 		 250 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  37.44 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  36.79 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  36.71 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  37.27 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  35.65 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  38.46 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  34.55 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  34.09 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  35.27 
 
 		 293 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  36.99 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  36.99 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  37.09 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  37.67 
 
 		 255 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  36.11 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  36.2 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  36.2 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  35.91 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  36.11 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  37.05 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  38.74 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  37.44 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  34.84 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  33.33 
 
 		 248 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  34.86 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  34.7 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  35.16 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  33.18 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  34.25 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  34.25 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  34.25 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  35.68 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  34.25 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  34.25 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  35.68 
 
 		 247 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  34.55 
 
 		 241 aa  134  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  36.65 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  34.22 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  35.21 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  36.36 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  34.55 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  37.1 
 
 		 301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  37.1 
 
 		 301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  33.79 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  35.14 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  37.1 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  35 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  39.13 
 
 		 211 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>