More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0187 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  59.91 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  59.45 
 
 		 221 aa  261  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  57.85 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  57.85 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  57.85 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  57.85 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  57.85 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  57.85 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  58.99 
 
 		 221 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  58.99 
 
 		 221 aa  254  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  57.27 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3095  surface presentation of antigens protein SpaP  60.36 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3200  surface presentation of antigens protein SpaP  60.36 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3080  surface presentation of antigens protein SpaP  60.36 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.833245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3043  surface presentation of antigens protein SpaP  60.36 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3012  surface presentation of antigens protein SpaP  60.36 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  44.39 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  46.84 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  43.87 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  43.4 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  44.62 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  41.15 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  37.9 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  37.9 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  38.86 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  42.92 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  42.92 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  42.92 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  42.92 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  42.92 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  41.98 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  43.07 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  43.07 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  43.07 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  40.19 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  39.25 
 
 		 287 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  39.25 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  41.23 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  39.9 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  40.1 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  38.84 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  38.84 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  40.39 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  36.41 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  36.02 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  36.62 
 
 		 293 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  35.05 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  40.3 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  38.35 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  39.29 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  38.78 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  34.1 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  36.84 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  36.27 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  36.36 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  36.36 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  36.36 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  36.36 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  36.36 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  37.77 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  36.36 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  33.64 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  38.46 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  36.36 
 
 		 262 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  33.18 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4067  flagellar biosynthetic protein FliP  35.21 
 
 		 339 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  36.15 
 
 		 289 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  33.18 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  36.7 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  36.06 
 
 		 255 aa  134  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  38.5 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  35.27 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  36.79 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  35.68 
 
 		 299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0706  flagellar biosynthesis protein FliP  38.86 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  35.29 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  37.33 
 
 		 301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  37.33 
 
 		 301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0626  flagellar biosynthesis protein FliP  39.38 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  34.58 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  36.41 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0239  flagellar biosynthesis protein FliP  38.86 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.197588  normal  0.0281676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  32.37 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  35.71 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1406  flagellar biosynthetic protein FliP  37.69 
 
 		 272 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  39.7 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2282  flagellar biosynthetic protein FliP  33.98 
 
 		 326 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  34.78 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  36.45 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  33.18 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  33.5 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  35.71 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  34.95 
 
 		 250 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  37.44 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>