More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1974 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  99.07 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  59.53 
 
 		 216 aa  262  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  59.53 
 
 		 216 aa  262  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  59.53 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  58.8 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  58.8 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  58.8 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  58.33 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  58.33 
 
 		 215 aa  257  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  54.46 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  55.09 
 
 		 216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  54.63 
 
 		 216 aa  234  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  55.84 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  54.17 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  45.97 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  45 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  47.64 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  45.45 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  45.45 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  45.45 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  44.84 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  44.84 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  38.43 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  39.13 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  39.13 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  39.13 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  38.43 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  38.43 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  39.62 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  41.28 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  40.19 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  43.3 
 
 		 311 aa  169  3e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  42.86 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  40.29 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  37.68 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  36.71 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  36.71 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  36.71 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  36.71 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  36.71 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  42.38 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  36.71 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  43.33 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  41.21 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  42.38 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  43.19 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  43.66 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  41.15 
 
 		 281 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  37.96 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 		 253 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  43.19 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  40.58 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  37.5 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  43.19 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  41.15 
 
 		 279 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  40.67 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  41.15 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  37.5 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  41.43 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  37.32 
 
 		 252 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  38.18 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  42.06 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  40.72 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  40.1 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  37.5 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  38.5 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  41.12 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  41.12 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  39.23 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  41.01 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  40.95 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  40.47 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  43.59 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  39.71 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  41.18 
 
 		 289 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  40.37 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  39.52 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  38.5 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  39.63 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  38.57 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  42.11 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  39.9 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  38.68 
 
 		 255 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  38.71 
 
 		 250 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  38.89 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  40.28 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  39.91 
 
 		 262 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  38.14 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  38.14 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  40.57 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>