More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5928 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  73.15 
 
 		 216 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  73.15 
 
 		 216 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  73.15 
 
 		 216 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  71.56 
 
 		 218 aa  321  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  71.56 
 
 		 218 aa  321  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  70.83 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  70.83 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  70.83 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  70.83 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  70.83 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  69.91 
 
 		 216 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  70.37 
 
 		 216 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  62.15 
 
 		 214 aa  278  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  62.15 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  63.64 
 
 		 220 aa  264  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  54.46 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  54.46 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  55.24 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  53.08 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  53.08 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  53.08 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  48.47 
 
 		 217 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  45.12 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  44.65 
 
 		 216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  45.12 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  45.27 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  45.77 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  38.43 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  38.43 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  41.74 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  37.21 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  37.21 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  37.21 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  37.73 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  38.54 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  46.04 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  36.63 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  36.45 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  36.45 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  36.45 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  36.45 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  41 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0745  type III secretion system protein  46.84 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0296702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  37.38 
 
 		 257 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  36.54 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  40.67 
 
 		 253 aa  147  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  36.61 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  36.61 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  36.61 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  36.61 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  36.61 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  36.61 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  40.67 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  36.06 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  40.78 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  38.69 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  36.54 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  40.39 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  39.91 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  37.24 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  35.96 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  38 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  34.62 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0703  type III secretion system protein  47.89 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00859025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  36.54 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  38.61 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  36.41 
 
 		 287 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  34.62 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  36 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  35.1 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  35.12 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  37.38 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0739  type III secretion system protein  46.63 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.177548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  36.54 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0738  type III secretion system protein  46.63 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  34.13 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  38 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  38.81 
 
 		 299 aa  141  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  36.89 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  37.44 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  36.89 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  37.24 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  38.24 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  36.89 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  39 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  38.81 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  38.81 
 
 		 289 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  37.44 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  37.38 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  33.65 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  34.87 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  38.24 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  38.35 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  37.19 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  38.24 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  37.38 
 
 		 276 aa  138  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  35.75 
 
 		 252 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  36.76 
 
 		 245 aa  138  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  36.97 
 
 		 276 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>