More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5212 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  71.16 
 
 		 211 aa  298  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  40.8 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  39.6 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  38.61 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  38.61 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  38.61 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  41 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  38.61 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  38.61 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  42.05 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  40.74 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  40.78 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  39.81 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  40.1 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  38.94 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  38.5 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  38.39 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  38.39 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  39.11 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  37.61 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  36.54 
 
 		 253 aa  141  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  37.86 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  37.86 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  37.38 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  37.86 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  37.86 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  37.86 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  36.74 
 
 		 261 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  41.55 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  37.38 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  37.38 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  36.87 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  36.7 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  36.57 
 
 		 251 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  38.68 
 
 		 287 aa  138  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  35.51 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  40.5 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  36.11 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  36.11 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  36.62 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  36.11 
 
 		 255 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  37.04 
 
 		 289 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  37.26 
 
 		 260 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  36.14 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  37.62 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  41.03 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  39.71 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  37.61 
 
 		 299 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  35.81 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  36.1 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  37.8 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  41.75 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  37.8 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  37.5 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  35.47 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  36.11 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  37.38 
 
 		 255 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  38.39 
 
 		 236 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  36.15 
 
 		 250 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  38.39 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  35.81 
 
 		 252 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  38.39 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  40.49 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  35.71 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  38.14 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  35.71 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  37.02 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  37.75 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  36.15 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  35.85 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  38.28 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  37.21 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  35.51 
 
 		 247 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  35.55 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  34.7 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  41.55 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  35.51 
 
 		 247 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  35.65 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  36.02 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  38.94 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  38.21 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0655  flagellar biosynthesis protein FliP  36.67 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  39.38 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  36.1 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  38.94 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  42.03 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  37.26 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  35.89 
 
 		 261 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  38.6 
 
 		 253 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  33.49 
 
 		 280 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  38.83 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>