More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003362 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  96.76 
 
 		 216 aa  411  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  76.39 
 
 		 217 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  74.54 
 
 		 217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  55.09 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  55.09 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  55.56 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  55.56 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  55.56 
 
 		 236 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  58.25 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  58.1 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  52.29 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  50.93 
 
 		 214 aa  230  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  51.83 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  51.83 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  51.83 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  52.29 
 
 		 224 aa  227  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  52.29 
 
 		 224 aa  227  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  53.92 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  53.92 
 
 		 215 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  53.92 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  53.92 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  53.92 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  45.16 
 
 		 218 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  45.16 
 
 		 218 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  44.65 
 
 		 216 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  45.58 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  50.24 
 
 		 217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  44.65 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  50.25 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  51.52 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  44.86 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  42.52 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  42.99 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  42.52 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  42.99 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1395  type III secretion protein HrcR  45.73 
 
 		 200 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  41.82 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  41.82 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  41.82 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  41.82 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  41.82 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  41.82 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  46.51 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  46.04 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  40.18 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3012  surface presentation of antigens protein SpaP  45.62 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3095  surface presentation of antigens protein SpaP  45.62 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3043  surface presentation of antigens protein SpaP  45.62 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3080  surface presentation of antigens protein SpaP  45.62 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.833245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3200  surface presentation of antigens protein SpaP  45.62 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  46.98 
 
 		 244 aa  177  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  46.98 
 
 		 244 aa  177  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  46.98 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2212  type III secretion system protein  45.24 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  45.12 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  46.04 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  44.02 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  43.4 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  44.02 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  44.02 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  45.58 
 
 		 244 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  44.5 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  45.45 
 
 		 251 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  44.76 
 
 		 293 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  43.06 
 
 		 283 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  44.98 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  45.58 
 
 		 243 aa  168  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  47.44 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  42.47 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  43.06 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  44.02 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  43.54 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  42.99 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  45.19 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  42.38 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  40.91 
 
 		 311 aa  165  5e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  41.9 
 
 		 287 aa  165  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  44.72 
 
 		 245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  44.72 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  44.72 
 
 		 245 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  44.72 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  44.72 
 
 		 245 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  44.72 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1885  type III secretion system protein  43.07 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  44.72 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  40.93 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  43.72 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  40.48 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  42.31 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>