More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3664 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3664  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
243 aa  471  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3481  flagellar biosynthesis protein FliP  83.2 
 
 
244 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3984  flagellar biosynthesis protein FliP  83.2 
 
 
244 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0083  flagellar biosynthesis protein FliP  84.35 
 
 
242 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0089  flagellar biosynthesis protein FliP  77.69 
 
 
242 aa  344  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  68.12 
 
 
255 aa  314  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  67.25 
 
 
252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3593  flagellar biosynthesis protein FliP  60.09 
 
 
245 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  63.98 
 
 
280 aa  262  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  57.81 
 
 
253 aa  261  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  56.78 
 
 
250 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  57.45 
 
 
248 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  57.45 
 
 
248 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  57.45 
 
 
248 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  57.45 
 
 
248 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  58.3 
 
 
255 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  58.08 
 
 
289 aa  256  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  59.11 
 
 
253 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  55.74 
 
 
248 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  55.6 
 
 
247 aa  254  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  59.46 
 
 
299 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  58.9 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  58.45 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  56.03 
 
 
248 aa  252  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  58.88 
 
 
255 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  58.88 
 
 
255 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  58.67 
 
 
289 aa  251  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  57.53 
 
 
255 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  58.01 
 
 
249 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0626  flagellar biosynthesis protein FliP  57.74 
 
 
256 aa  250  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 
247 aa  249  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  58.22 
 
 
289 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  55.98 
 
 
249 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  56.74 
 
 
251 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 
248 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  56.12 
 
 
248 aa  248  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  56.12 
 
 
248 aa  248  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  57.27 
 
 
251 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  56.12 
 
 
248 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  57.82 
 
 
278 aa  248  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  58.6 
 
 
245 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0239  flagellar biosynthesis protein FliP  56.9 
 
 
256 aa  248  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.197588  normal  0.0281676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0706  flagellar biosynthesis protein FliP  56.9 
 
 
256 aa  248  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  56.12 
 
 
251 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  56.82 
 
 
251 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  56.94 
 
 
250 aa  245  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4422  flagellar biosynthesis protein FliP  60.18 
 
 
250 aa  245  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.633986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  58.82 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  55.46 
 
 
252 aa  245  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  57.08 
 
 
262 aa  244  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  58.37 
 
 
274 aa  244  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  56.11 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  56 
 
 
251 aa  242  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  56.05 
 
 
256 aa  242  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801028  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  49.8 
 
 
262 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  54.75 
 
 
249 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  54.75 
 
 
249 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  53.36 
 
 
250 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
250 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  56.84 
 
 
247 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  51.08 
 
 
261 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  56.94 
 
 
264 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  52.49 
 
 
301 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  53 
 
 
251 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  52.49 
 
 
301 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  53 
 
 
251 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 
274 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 
274 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  51.93 
 
 
246 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  51.75 
 
 
254 aa  234  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
276 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
276 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  52.65 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  53.46 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  54.63 
 
 
281 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  55.51 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  58.73 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  55.98 
 
 
265 aa  231  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  51.98 
 
 
277 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  52.79 
 
 
258 aa  231  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  55.02 
 
 
254 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  56.22 
 
 
257 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  51.54 
 
 
279 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  54.85 
 
 
253 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  51.34 
 
 
253 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  53.11 
 
 
253 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  51.34 
 
 
253 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  51.34 
 
 
253 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  51.34 
 
 
253 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  53.11 
 
 
245 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  54.07 
 
 
245 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  54.07 
 
 
245 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  54.07 
 
 
245 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  54.07 
 
 
245 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  54.07 
 
 
245 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  51.63 
 
 
247 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  52.23 
 
 
251 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  54.63 
 
 
253 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>